<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<meta name="Generator" content="Microsoft Exchange Server">
<!-- converted from text --><style><!-- .EmailQuote { margin-left: 1pt; padding-left: 4pt; border-left: #800000 2px solid; } --></style>
</head>
<body>
<meta content="text/html; charset=UTF-8">
<style type="text/css" style="">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
</style>
<div dir="ltr">
<div id="x_divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p><br>
</p>
<p>Hi Peng,</p>
<p><br>
</p>
<p>If you can send me the case files (.rea/.re2/.usr/SIZE) off-list, I'll take a look.</p>
<p><br>
</p>
<p>Paul</p>
<p><br>
</p>
</div>
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="x_divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Nek5000-users <nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov> on behalf of nek5000-users@lists.mcs.anl.gov <nek5000-users@lists.mcs.anl.gov><br>
<b>Sent:</b> Thursday, August 10, 2017 11:52:22 AM<br>
<b>To:</b> nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>
<b>Subject:</b> Re: [Nek5000-users] call quickmv</font>
<div> </div>
</div>
</div>
<font size="2"><span style="font-size:10pt;">
<div class="PlainText">OK, I modified my original codes by commenting the assignment of nelx,nely,nelz, and run the codes with the latest Nek5000 on github.<br>
Now the call quickmv works, but after a few steps the run stoped with error of:<br>
<br>
19  ERROR:  Vanishing Jacobian near    450th node of element      3417.<br>
   15  ERROR:  Vanishing Jacobian near    454th node of element      3478.<br>
   1.5645096459630245E-005  -1.9908715070160847E-006<br>
   7.8803469694853321E-005  -2.2849600652699913E-006<br>
   19 xyz:   5.58505E+00   6.98131E-01  -4.35408E-03<br>
   15 xyz:   3.77072E+00   1.04720E+00  -3.76170E-03<br>
   19 xyz:   5.59625E+00   6.98131E-01  -4.51949E-03<br>
   15 xyz:   3.80409E+00   1.04720E+00  -4.52225E-03<br>
<br>
<br>
   21  ERROR:  Vanishing Jacobian near    453th node of element      3414.<br>
   3.5060560562872155E-005  -4.3793300951698337E-006<br>
   21 xyz:   5.13046E+00   6.98131E-01  -4.17197E-03<br>
   21 xyz:   5.16699E+00   6.98131E-01  -4.54190E-03<br>
<br>
…<br>
<br>
I am not sure what have been changed for the moving-mesh modelling in the latest Nek5000.<br>
My codes works very well with the old Nek5000.<br>
<br>
Thanks,<br>
Peng<br>
<br>
> On Aug 10, 2017, at 10:42 AM, nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov wrote:<br>
> <br>
> It looks like something goes wrong with MPI. Please update your Nek5000 installation to the latest MASTER on GitHub. Can you run one of the short_test e.g. (ethier) to see if there is general problem?<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
</div>
</span></font>
</body>
</html>