<div dir="ltr"><div>Hello, Thanks for your help. Please see below for the log file.<br><br></div>Ajay<br><br><br>#######################<br> Number of processors:           8<br> REAL    wdsize      :           8<br> INTEGER wdsize      :           4<br> Timer accuracy      : 7.87E-07<br> Reading /home/ajay/nek5_svn/runs/smallcylinder/simplecylinder.rea                                                                             <br><br> mapping elements to processors<br> Reading /home/ajay/nek5_svn/runs/smallercylinder/simpleduct.map                                                                             <br>           0        2827        2827       22620       22620  NELV<br>           1        2828        2828       22620       22620  NELV<br>           2        2827        2827       22620       22620  NELV<br>           3        2828        2828       22620       22620  NELV<br>           4        2827        2827       22620       22620  NELV<br>           5        2828        2828       22620       22620  NELV<br>           6        2827        2827       22620       22620  NELV<br>           7        2828        2828       22620       22620  NELV<br> RANK     0 IEG      73      74      75      76      77      78      79      80<br>                     81      82      83      84      85      86      87      88<br>                     89      90      91      92      93      94      95      96<br>                     97      98      99     100     101     102     103     104<br>                    105     106     107     108     109     110     111     112<br>.<br>.<br>                  19702   19703   19704   19705   19706   19707   19708   19709<br>                  19710   19711   19712   19713   19714   19715   19716   19717<br>                  19718   19719   19720<br> element load imbalance:            1        2827        2828<br> done :: mapping elements to processors<br>  <br>           0  objects found<br> 103   Parameters from file:<br>   1      1.00000         p1  DENSITY<br>   2     -500.000         p2  VISCOS<br>   7      1.00000         p7  RHOCP<br>   8      1.00000         p8  CONDUCT<br>  11      10000           p11 NSTEPS<br>  12      0.10000E-05     p12 DT<br>  15      5               p15 IOSTEP<br>  18     -20.00000        p18 GRID<br>  19     -1.00000         p19 INTYPE<br>  20      10.0000         p20 NORDER<br>  26      1.00000         p26 COURANT/NTAU<br>  27      2.00000         p27 TORDER<br>  65      1.00000         p65 #iofiles (eg, 0 or 64); <0 --> sep. dirs<br>  66      4.00000         p66 output : <0=ascii, else binary<br>  67      4.00000         p67 restart: <0=ascii, else binary<br>  93      20.0000          p93 Number of previous pressure solns saved<br>  94      3.00000          p94 start projecting velocity after p94 step<br>  95      5.00000          p95 start projecting pressure after p95 step<br>  99      0.               p99   dealiasing: <0--> off/3--> old/4--> new<br> 102      1.00000          p102   Dump out divergence at each time step<br> 103     -1.00000          p103   weight of stabilizing filter (.01)<br>  <br> nelgt/nelgv/lelt:       22620       22620        4800<br> lx1  /lx2  /lx3 :           4           2           4<br> done :: read .rea file   0.31992     sec<br><br> Reset the target Courant number to .5<br> setup mesh topology<br>   Right-handed check complete for   22620 elements. OK.<br>   setvert3d:   4      442198      623158      442198      442198<br> call usrsetvert<br> done :: usrsetvert<br><br>gs_setup: 30559 unique labels shared<br>   pairwise times (avg, min, max): 0.000139931 0.000135946 0.000145721<br>   crystal router                : 0.000256464 0.000254369 0.000258589<br>   all reduce                    : 0.00160212 0.00160019 0.00160458<br>   used all_to_all method: pairwise<br>   handle bytes (avg, min, max): 1.84397e+06 1811380 1886892<br>   buffer bytes (avg, min, max): 127744 104448 159248<br>   setupds time 2.7611E-01 seconds   0  4      442198       22620<br>           8  max multiplicity<br> done :: setup mesh topology<br>  <br> call usrdat<br> done :: usrdat<br><br> generate geometry data<br> done :: generate geometry data<br>  <br> call usrdat2<br> done :: usrdat2<br><br> regenerate geometry data           1<br> done :: regenerate geometry data           1<br>  <br> verify mesh topology<br>  0.000000000000000E+000   40.0000037000000       Xrange<br> -0.999999929000000       0.999999933000000       Yrange<br> -0.999999934000000       0.999999930000000       Zrange<br> done :: verify mesh topology<br>  <br> IFTRAN   = T<br> IFFLOW   = T<br> IFHEAT   = F<br> IFSPLIT  = F<br> IFLOMACH = F<br> IFUSERVP = F<br> IFUSERMV = F<br> IFSTRS   = F<br> IFCHAR   = F<br> IFCYCLIC = F<br> IFAXIS   = F<br> IFMVBD   = F<br> IFMELT   = F<br> IFMODEL  = F<br> IFKEPS   = F<br> IFMOAB   = F<br> IFNEKNEK = F<br> IFSYNC   = T<br>   <br> IFVCOR   = F<br> IFINTQ   = F<br> IFCWUZ   = F<br> IFSWALL  = F<br> IFGEOM   = F<br> IFSURT   = F<br> IFWCNO   = F<br> IFCMT    = F<br> IFVISC   = F<br> IFFLTR   = F<br>   <br> IFTMSH for field           1    =  F<br> IFADVC for field           1    =  T<br> IFNONL for field           1    =  F<br>   <br> Dealiasing enabled, lxd=           6<br>  <br> Estimated eigenvalues<br> EIGAA =    1.64699045940739     <br> EIGGA =    96667.1875918256     <br> EIGAE =   6.168501609507998E-003<br> EIGAS =   3.121097622977694E-004<br> EIGGE =    96667.1875918256     <br> EIGGS =    2.00000000000000     <br>  <br> verify mesh topology<br>  0.000000000000000E+000   40.0000037000000       Xrange<br> -0.999999929000000       0.999999933000000       Yrange<br> -0.999999934000000       0.999999930000000       Zrange<br> done :: verify mesh topology<br>  <br>  E-solver strategy:  1 itr<br><br>Matrix:   0 aa         4       4       4<br>  0 aa        Infinity  -4.08542E+02   7.41342E+01   0.00000E+00<br>  0 aa    -4.08542E+02   4.65569E+02  -1.31161E+02   0.00000E+00<br>  0 aa     7.41342E+01  -1.31161E+02   7.04788E+01   0.00000E+00<br>  0 aa     0.00000E+00   0.00000E+00   0.00000E+00   1.00000E+00<br><br>Matrix:   0 bb         4       4       4<br>  0 bb             NaN   0.00000E+00   0.00000E+00   0.00000E+00<br>  0 bb     0.00000E+00   2.66276E-02  -5.47992E-03   0.00000E+00<br>  0 bb     0.00000E+00  -5.47992E-03   2.45184E-02   0.00000E+00<br>  0 bb     0.00000E+00   0.00000E+00   0.00000E+00   1.00000E+00<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br><br>Matrix:   0 Aeig       4       4       4<br>  0 Aeig           NaN           NaN           NaN           NaN<br>  0 Aeig           NaN           NaN           NaN           NaN<br>  0 Aeig           NaN           NaN           NaN           NaN<br>  0 Aeig           NaN           NaN           NaN           NaN<br><br>Matrix:   0 Deig       1       4       4<br>  0 Deig           NaN           NaN           NaN           NaN<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br> Error in generalev, info=           3           4           1<br>  <br>call exitt: dying ...<br>  <br>backtrace(): obtained 10 stack frames.<br>./nek5000() [0x6b38f9]<br>./nek5000() [0x8262fa]<br>./nek5000() [0x546de7]<br>./nek5000() [0x68bd34]<br>./nek5000() [0x66424d]<br>./nek5000() [0x40a834]<br>./nek5000() [0x408e17]<br>./nek5000() [0x408ca6]<br>/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf0) [0x7fb5451ef9f0]<br>./nek5000() [0x408b29]<br>  <br>total elapsed time             :   2.33935E+00 sec<br>total solver time incl. I/O    :   0.00000E+00 sec<br>time/timestep                  :   0.00000E+00 sec<br>CPU seconds/timestep/gridpt    :   0.00000E+00 sec<br><br><br>#######################<br></div>