<div dir="ltr">Hi Paul,<div><br></div><div>I changed the elements in the straight pipe which is I am doing at the moment. I set the horizontal and vertical axis as 14 spectral elements in the quarter-section for the simulation at Re=5300 based on bulk velocity. And the pipe length is 25R. Do you think it's enough to run the simulation? By the way, I run the simulation for a short time, after which I used visit to check the mesh finding that there are several things inside the pipe which are likely to be walls. And I found the mesh in visit shows that the cross-sectional views are different in the outlet and inlet which is open or closed. I set the axis view in visit to not show the axis. </div><div><br></div><div>Kind regards,</div><div><br></div><div>Jian</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 27 June 2017 at 18:00,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov" target="_blank">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Send Nek5000-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
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To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/<wbr>mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
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<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Nek5000-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
      (<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>)<br>
   2. Re: Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
      (<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>)<br>
<br>
<br>
------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>----------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Mon, 26 Jun 2017 18:06:06 +0100<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.9646.1498496769.2967.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.9646.1498496769.2967.<wbr>nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Hi Paul,<br>
<br>
Now the number of total elements is 576000 written in the rea file. By the<br>
way, would you please tell me the reason why only 1/1000 number of elements<br>
are needed indeed with SEM.<br>
<br>
Kind regards,<br>
<br>
Jian<br>
<br>
<br>
> Message: 2<br>
> Date: Mon, 26 Jun 2017 15:27:28 +0000<br>
> From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
> To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>"<br>
>         <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
> Subject: Re: [Nek5000-users] genmap<br>
> Message-ID:<br>
>         <<a href="mailto:mailman.9625.1498490850.2967.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.9625.1498490850.2967.<wbr>nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
> Content-Type: text/plain; charset="us-ascii"<br>
><br>
><br>
> Dear Jiang,<br>
><br>
><br>
> I think you have too many elements.  Keep in mind that with the SEM you<br>
> need about 1/1000th of the number of elements that you would for FEM.<br>
><br>
><br>
> What is the largest SEM run you have made so far?<br>
><br>
><br>
> Best, Paul<br>
><br>
><br>
> ______________________________<wbr>__<br>
> From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a> <<br>
> <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a>> on behalf of<br>
> <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
> Sent: Monday, June 26, 2017 8:49:06 AM<br>
> To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
> Subject: [Nek5000-users] genmap<br>
><br>
> Hi Neks,<br>
><br>
> Is there anyone know the reason for the following error, in which there<br>
> are hundred millions of grid points in the geometry.<br>
><br>
>  ABORT: NELT>LELM, modify LELM in SIZE and recompile<br>
><br>
> I changed the LELM to be big enough, even equals to 7000000000000, but it<br>
> doesn't work though. I guess the reasons would be:<br>
><br>
> 1. genmap cannot regonize large elements mesh;<br>
> 2. I didn't get a recompilation after changing LELM parameter since I<br>
> don't know how to compile and thought genmap commond would be changed<br>
> automatically when the SIZE file in /home/bin/genmap was changed.<br>
><br>
> Kind regards,<br>
><br>
> Jian<br>
> -------------- next part --------------<br>
> An HTML attachment was scrubbed...<br>
> URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/<wbr>pipermail/nek5000-users/</a><br>
> attachments/20170626/74ae123f/<wbr>attachment-0001.html><br>
><br>
> ------------------------------<br>
><br>
> ______________________________<wbr>_________________<br>
> Nek5000-users mailing list<br>
> <a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
> <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/<wbr>mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
><br>
><br>
> End of Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
> ******************************<wbr>****************<br>
><br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20170626/a406c1da/attachment-0001.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/<wbr>pipermail/nek5000-users/<wbr>attachments/20170626/a406c1da/<wbr>attachment-0001.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Mon, 26 Jun 2017 19:18:22 +0000<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>"<br>
        <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.9661.1498504705.2967.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.9661.1498504705.2967.<wbr>nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="us-ascii"<br>
<br>
<br>
Dear Jiang,<br>
<br>
<br>
If you run with lx1=10 you have 1000 points per element.<br>
<br>
<br>
FEM never runs with 10th order - the SEM is meant to do this.<br>
<br>
<br>
What is the largest SEM problem you have run so far?  I recommend starting with a sequence of small ones just to get used to the workflow.<br>
<br>
<br>
Paul<br>
<br>
<br>
______________________________<wbr>__<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a>> on behalf of <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>><br>
Sent: Monday, June 26, 2017 12:06:06 PM<br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
<br>
Hi Paul,<br>
<br>
Now the number of total elements is 576000 written in the rea file. By the way, would you please tell me the reason why only 1/1000 number of elements are needed indeed with SEM.<br>
<br>
Kind regards,<br>
<br>
Jian<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Mon, 26 Jun 2017 15:27:28 +0000<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>><br>
To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>>"<br>
        <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>>><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] genmap<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.9625.1498490850.2967.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.9625.1498490850.2967.<wbr>nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:mailman.9625.1498490850.2967.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.9625.<wbr>1498490850.2967.nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>>><br>
Content-Type: text/plain; charset="us-ascii"<br>
<br>
<br>
Dear Jiang,<br>
<br>
<br>
I think you have too many elements.  Keep in mind that with the SEM you need about 1/1000th of the number of elements that you would for FEM.<br>
<br>
<br>
What is the largest SEM run you have made so far?<br>
<br>
<br>
Best, Paul<br>
<br>
<br>
______________________________<wbr>__<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-<wbr>users-bounces@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>> <<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.<wbr>mcs.anl.gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-<wbr>users-bounces@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a>>> on behalf of <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>> <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>>><br>
Sent: Monday, June 26, 2017 8:49:06 AM<br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Subject: [Nek5000-users] genmap<br>
<br>
Hi Neks,<br>
<br>
Is there anyone know the reason for the following error, in which there are hundred millions of grid points in the geometry.<br>
<br>
 ABORT: NELT>LELM, modify LELM in SIZE and recompile<br>
<br>
I changed the LELM to be big enough, even equals to 7000000000000, but it doesn't work though. I guess the reasons would be:<br>
<br>
1. genmap cannot regonize large elements mesh;<br>
2. I didn't get a recompilation after changing LELM parameter since I don't know how to compile and thought genmap commond would be changed automatically when the SIZE file in /home/bin/genmap was changed.<br>
<br>
Kind regards,<br>
<br>
Jian<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20170626/74ae123f/attachment-0001.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/<wbr>pipermail/nek5000-users/<wbr>attachments/20170626/74ae123f/<wbr>attachment-0001.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><mailto:<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@<wbr>lists.mcs.anl.gov</a>><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/<wbr>mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br>
<br>
End of Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 29<br>
******************************<wbr>****************<br>
<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20170626/ccc11744/attachment-0001.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/<wbr>pipermail/nek5000-users/<wbr>attachments/20170626/ccc11744/<wbr>attachment-0001.html</a>><br>
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______________________________<wbr>_________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.<wbr>gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/<wbr>mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br>
<br>
End of Nek5000-users Digest, Vol 100, Issue 30<br>
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