<div dir="ltr">Hello Jing,<div><br></div><div>Recently I am also working on converting fluent mesh to nek5000. I have generated the *msh from gambit, then using the mshconvert.py tool to convert a simple mesh with a circular cylinder inside a square.</div><div><br></div><div>simply, I can get the *rea file with circle of the "W", "v" and "O". but I have met two problems;</div><div><br></div><div>1. to impose the periodic boundary conditons: in the script, it strongly recommend to impose "P" through the script, then how to setup it in mshconvert.py? the way </div><div><span style="font-size:14px"><br></span></div><div><span style="font-size:14px">convert('mesh.msh', bcs={1:'W',2:'v',3:'O',4:'</span><span style="font-size:14px">P', 5:'P'})</span></div><div><span style="font-size:14px"><br></span></div><div><span style="font-size:14px">can generate the rea field but failed in the step of genmap. so how to treat boundary 4 and 5 as periodic BCs?</span></div><div><span style="font-size:14px"><br></span></div><div><span style="font-size:14px">2. about the curved wall. there is no problem to  define a circle by "Circle" command, but if I want to using "m" to define a spline curve, how to seed middle points? I know in Gambit I can mesh the line using 3 node, I defined 3 node mode to mesh a circle, and using "m" instead of "circle", however,  it failed to generate the rea file. the circle merged into a point, then what should I do to active the spline curve?</span></div><div><span style="font-size:14px"><br></span></div><div><span style="font-size:14px">Thanks!</span></div><div><span style="font-size:14px"><br></span></div><div><span style="font-size:14px">Wei</span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-06-08 15:46 GMT+02:00  <span dir="ltr"><<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov" target="_blank">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Mansi,<br>
<br>
You can find the updated "mshconvert.py" in the attachment.  You can run the script for your case likes<br>
<br>
###<br>
$ ipython<br>
<br>
In [1]: from mshconvert import *<br>
Converting from ANSYS Fluent format (.msh) to Nek5000, semtex or FEniCS format<br>
<br>
In [2]: convert('mesh_hexa_final.msh', bcs={10:'W',11:'v',12:'v',13:'O'})<br>
...<br>
###<br>
<br>
Here I assume that BC "W" is on zone 10, "v" is on zones 11 and 12, and 'O' on zone 13.<br>
<br>
The snapshot for the Nek5000 mesh using visit is also attached in the email.<br>
<br>
/Jing<br>
<br>
<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a>> on behalf of <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Sent: Monday, June 6, 2016 22:09<br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
Subject: Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 5<br>
<br>
Send Nek5000-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Nek5000-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 4,        Problem creating<br>
      .rea file (<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Mon, 6 Jun 2016 19:58:31 +0000<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>"<br>
        <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 4,<br>
        Problem creating .rea file<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.23344.1465243753.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.23344.1465243753.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hello all,<br>
<br>
<br>
Thanks jing, that was a lot helpful to me.<br>
<br>
I have generated the .msh file for the hexahedral mesh for my geometry. File is attached to this mail.<br>
<br>
<br>
I have given boundary condition in this file only let me know if there are any changes to be made and file has only one zone( if by one zone you mean only 1 type of mesh through out whole geometry).<br>
<br>
<br>
Questions:<br>
<br>
1) Users, what are other ways to convert (Icem cfd) .msh  file to .rea file?<br>
<br>
2) is there any way to smooth hexahedral mesh for unstructured geometry?<br>
<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Mansi Patel<br>
<br>
<br>
________________________________<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a>> on behalf of <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Sent: Friday, June 3, 2016 1:00 PM<br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
Subject: Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 4<br>
<br>
Send Nek5000-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Nek5000-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 3<br>
      (<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Thu, 2 Jun 2016 21:21:13 +0000<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>"<br>
        <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Subject: Re: [Nek5000-users] Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 3<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.23169.1464902611.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.23169.1464902611.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hi Mansi,<br>
<br>
1)what should I do to solve error?<br>
<br>
Right now mshconvert can only deal with single zone's case. So you should have to manually merge the multi-zone to single-zone in the .msh file.<br>
<br>
Also we found that there are few bugs in the file.  Could you please send us your .msh file to test  and then we will get back to you with the corrected version?<br>
<br>
2)what are mesh types that we can use?<br>
Quadrant  for 2D- and hexahedral for 3D-cases.<br>
<br>
3) I there any other easy way to convert .msh file to .rea?<br>
I leave this question to other users.<br>
<br>
Thanks.<br>
<br>
Regards, Jing<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a>> on behalf of <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a> <<a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Sent: Thursday, June 2, 2016 19:17<br>
To: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
Subject: Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 3<br>
<br>
Send Nek5000-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-request@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-owner@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Nek5000-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. problems in generating .rea file (<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Thu, 2 Jun 2016 17:12:11 +0000<br>
From: <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
To: "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>"<br>
        <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Subject: [Nek5000-users] problems in generating .rea file<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:mailman.23153.1464887866.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">mailman.23153.1464887866.24727.nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hello all,<br>
<br>
I want to ask what type of mesh does Nek5000 accept? tetrahedral, hexahedral,etc?<br>
<br>
Because I am using ICEM CFD for generating mesh which has extension .msh and for that I used python code given for mshconvert to convert into .rea file but I am getting error. the error image is attached.<br>
<br>
Please let me know following questions<br>
<br>
1)what should I do to solve error?<br>
<br>
2)what are mesh types that we can use?<br>
<br>
3) I there any other easy way to convert .msh file to .rea?<br>
<br>
<br>
Thanks, any help would be appreciated.<br>
<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Mansi Patel<br>
<br>
<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160602/aaf91e41/attachment.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160602/aaf91e41/attachment.html</a>><br>
-------------- next part --------------<br>
A non-text attachment was scrubbed...<br>
Name: error.png<br>
Type: image/png<br>
Size: 91392 bytes<br>
Desc: error.png<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160602/aaf91e41/attachment.png" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160602/aaf91e41/attachment.png</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br>
<br>
End of Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 3<br>
********************************************<br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br>
<br>
End of Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 4<br>
********************************************<br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160606/e07ab762/attachment.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160606/e07ab762/attachment.html</a>><br>
-------------- next part --------------<br>
A non-text attachment was scrubbed...<br>
Name: mesh_hexa_final.msh<br>
Type: application/octet-stream<br>
Size: 24802571 bytes<br>
Desc: mesh_hexa_final.msh<br>
URL: <<a href="http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160606/e07ab762/attachment.obj" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/nek5000-users/attachments/20160606/e07ab762/attachment.obj</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br>
<br>
End of Nek5000-users Digest, Vol 88, Issue 5<br>
********************************************<br>
<br>_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><font size="4"><b><font face="arial narrow,sans-serif"><br></font></b></font><span><div><font face="Bookman Old Style"><font color="#7f7f7f">Wei HE 何偉<br></font></font></div><div><font face="Bookman Old Style" color="#7f7f7f">School of Aeronautics</font></div><div><font face="Bookman Old Style" color="#7f7f7f">Universidad Politécnica de Madrid</font></div></span><a href="http://www.cfm.upm.es/" target="_blank">http://www.cfm.upm.es/</a><br></div></div></div>
</div>