<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:Arial"><div>Hi, Paul:<br>     I read the nekbmpi file and find this:<br>    mpiexec -np $2 ./nek5000 > $1.log.$2 &<br>    so the nek5000 is executed by mpi. In mpich, the common way to run a executable program can be run as :<br>    mpiexec -n XX ./nek5000<br></div><div>    However, when I type this:<br>    mpiexec -n 32 ./nek5000 > turbChannel.log &<br>    error returns like:<br>     Fortran runtime error: File './NEK.rea' does not exist<br>Best reguards<br>Xianbei<br></div><br><br><br><div></div><div id="divNeteaseMailCard"></div><br>At 2014-06-04 11:20:52, nek5000-users@lists.mcs.anl.gov wrote:<br> <blockquote id="isReplyContent" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">


<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>


<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<div><br>
</div>
Hi Xianbei,
<div><br>
</div>
<div>Have a look at the nekbmpi script and modify to match the job submission</div>
<div>procedure on your cluster.</div>
<div><br>
</div>
<div>Paul</div>
<div><br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF636972" style="direction: ltr;"><font color="#000000" face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> <a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a> [<a href="mailto:nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov</a>] on behalf of <a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a> [<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, June 04, 2014 9:34 AM<br>
<b>To:</b> Nek5000<br>
<b>Subject:</b> [Nek5000-users] How to run Nek5000 in cluster based on mpich?<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div style="line-height:1.7; color:#000000; font-size:14px; font-family:Arial">
<div>Hi,all:<br>
   I have just built a small cluster of computers, based on mpich.I have tested the capability of this cluster, each node can be called freely.  Now I want to do my simulation in it, however, I don't know how to run Nek. As known, on only 1 computer, one can
 do like this:<br>
  nekmpi XXX X <br>
or<br>
  nekbmpi XXX X<br>
  while this is not the case in the cluster! I believe most of you have tried this, I'll appreciate if anyone can give me some advice.<br>
Best regards<br>
Xianbei <br>
</div>
</div>
<br>
<br>
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<div id="netease_mail_footer">
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</div>
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</div>
</div>
</div>


</blockquote></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"><div id="netease_mail_footer"><div style="border-top:#CCCCCC 1px solid;padding:10px 5px;font-size:12px;color:#666;line-height:22px">来自网易手机号码邮箱<a id="mobile_set" sys="1" log=1 logid="free_sms_20120504" href="http://shouji.163.com" target="_blank" style="color:#0000FF">了解更多</a></div></div>
</span></span>