
<html><head><style type='text/css'>p { margin: 0; }</style></head><body><div style='font-family: Times New Roman; font-size: 12pt; color: #000000'>Paul,<br><br>Yes I tried gzip and gunzip but it is telling me that it is not in a zipped format: <br><br> gunzip genmap.f.gz <br>gzip: genmap.f.gz: not in gzip format<br><br>What do you mean by locale?<br><br><br>----- Original Message -----<br>From: nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>To: nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>Sent: Tuesday, June 22, 2010 10:24:24 AM GMT -06:00 Guadalajara / Mexico City / Monterrey<br>Subject: Re: [Nek5000-users] Periodic BC & Genmap issue<br><br><br>did you<br><br>gunzip genmap.f.gz<br><br>?<br><br><br>On Tue, 22 Jun 2010, nek5000-users@lists.mcs.anl.gov wrote:<br><br>> Paul,<br>><br>> I am having trouble accessing the zipped file, when I try to decompress it tells me that it is not in gzip format. Perhaps try again, or another format?<br>><br>> - Michael<br>><br>> ----- Original Message -----<br>> From: nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>> To: "Nekton User List" <nek5000-users@lists.mcs.anl.gov><br>> Sent: Tuesday, June 22, 2010 1:47:35 AM GMT -06:00 Guadalajara / Mexico City / Monterrey<br>> Subject: Re: [Nek5000-users] Periodic BC & Genmap issue<br>><br>><br>> Hi Michael,<br>><br>> It looks like the issue is related to the mesh and to tolerances.<br>> It appears to me that the periodic faces are not congruent - nearly<br>> so, but not 100%.<br>><br>> I've changed my version of genmap to make the tolerance in the<br>> periodicity check reflect the user-prompted value. I'm not yet<br>> commiting this to the repo because I need to think more about the<br>> consequences. However, the attached code does work when you input<br>> ".1" for the tolerance prompt - and it flags an error when you put<br>> in .01 or smaller. Try diff'g this against your current version<br>> to see the change.<br>><br>> Paul<br>><br>> PS - rather than attaching, I'm placing in<br>> www.mcs.anl.gov/~fischer/genmap.f.gz<br>><br>><br>> On Mon, 21 Jun 2010, nek5000-users@lists.mcs.anl.gov wrote:<br>><br>>> Hi,<br>>><br>>> I am running into an error when trying to use genmap. I believe it has to do with the periodic boundary conditions I have set up. I have checked the elements, and faces and indeed they are given correctly. This leads me to believe that there may be an issue with genmap. I have attached the rea file. This was to test the periodic faces for this geometry. The output is shown below, thanks for any help with this.<br>>><br>>> - Michael M.<br>>><br>>> Here is the output:<br>>><br>>> test<br>>> Input mesh tolerance (default 0.2):<br>>> NOTE: smaller is better, but generous is more forgiving for bad meshes.<br>>> .2<br>>> reading .rea file data ...<br>>> start locglob_lexico: 8 60 480 0.20000000000000001<br>>> locglob: 1 1 480<br>>> locglob: 2 27 480<br>>> locglob: 3 42 480<br>>> locglob: 1 168 480<br>>> locglob: 2 168 480<br>>> locglob: 3 168 480<br>>> locglob: 1 168 480<br>>> locglob: 2 168 480<br>>> locglob: 3 168 480<br>>> done locglob_lexico: 168 168 480 4<br>>> start periodic vtx: 60 168<br>>> 1 3 5 3 3.66325334E-04 1 shift<br>>> 3 4 4 Matrix: x0<br>>> 1 x0 1.7389E-03 2.8363E-03 2.8363E-03 1.7389E-03<br>>> 2 x0 -6.9998E-02 7.0969E-02 6.9026E-02 -6.9998E-02<br>>> 3 x0 2.0879E-02 2.0879E-02 -2.0937E-02 -2.0821E-02<br>>> 4 x0 8.3935E-03 8.0685E-03 -2.4856E-02 8.3935E-03<br>>> 1 4 4 Matrix: x1<br>>> 1 x1 1.7389E-03 1.7389E-03 2.8351E-03 2.8351E-03<br>>> 2 x1 -7.0107E-02 -7.0107E-02 6.8930E-02 7.1286E-02<br>>> 3 x1 2.0876E-02 -2.0824E-02 -2.0927E-02 2.0876E-02<br>>> 4 x1 8.3867E-03 8.3867E-03 -2.4834E-02 8.0608E-03<br>>> 3 4 4 Matrix: z0<br>>> 1 z0 1.7389E-03 2.8363E-03 2.8363E-03 1.7389E-03<br>>> 2 z0 -1.2500E+00 -1.1090E+00 -1.1110E+00 -1.2500E+00<br>>> 3 z0 0.0000E+00 0.0000E+00 -4.1816E-02 -4.1700E-02<br>>> 4 z0 -5.0620E-01 -5.0653E-01 -5.3945E-01 -5.0620E-01<br>>> 1 4 4 Matrix: z1<br>>> 1 z1 1.7389E-03 1.7389E-03 2.8351E-03 2.8351E-03<br>>> 2 z1 -1.2500E+00 -1.2500E+00 -1.1110E+00 -1.1086E+00<br>>> 3 z1 0.0000E+00 -4.1700E-02 -4.1803E-02 0.0000E+00<br>>> 4 z1 4.9380E-01 4.9380E-01 4.6058E-01 4.9347E-01<br>>> 3 4 3 1.00000000E-03 7.09692500E-02 abort: FACE MATCH FAIL<br>>> 1 3 5 7.09692500E-05 3.66325334E-04 abort: FACE MATCH FAIL<br>>><br>>><br>> _______________________________________________<br>> Nek5000-users mailing list<br>> Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>> https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users<br>><br>_______________________________________________<br>Nek5000-users mailing list<br>Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov<br>https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users<br></div></body></html>