Dear Sir,<div><br></div><div>I have all the requirements that you mentioned in your last mail. I just want to know how to cluster them , so that I can utilize the power of both for single computational work...<br><br><div class="gmail_quote">
On Mon, Oct 15, 2012 at 10:29 PM, Svancara, Randall <span dir="ltr"><<a href="mailto:rsvancara@wsu.edu" target="_blank">rsvancara@wsu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div>
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">
<div>I would say at a minimum, you need a dedicated gigabit Ethernet between the two machines, and an operating system that can support MPICH and Gromacs.  Also you will need a compiler to build all the software as well.  Lastly, your cluster will need to support
 SSH or some way to launch all the MPI daemons on both systems.    </div>
<div><br>
I would start by learning how to use MPI Software to run on one node and then work on expanding to a multinode setup.   Also, you might be better served by starting out with one of the many MPI Hello World implementations and starting there as a learning platform
 and working your way up to more complex programs like Gromacs.  Once you have a fundamental understanding of all the working pieces, you will have a much better user experience.    </div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,<br>
<br>
Randall</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<br>
<div style="font-size:16px;font-family:Times New Roman">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font face="Tahoma" color="#000000"><b>From:</b> <a href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" target="_blank">mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</a> [<a href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" target="_blank">mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</a>] on behalf of bharat gupta [<a href="mailto:bharat.85.monu@gmail.com" target="_blank">bharat.85.monu@gmail.com</a>]<br>

<b>Sent:</b> Friday, October 12, 2012 8:51 PM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" target="_blank">mpich-discuss@mcs.anl.gov</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [mpich-discuss] Clustering<br>
</font><br>
</div><div><div class="h5">
<div></div>
<div>Hi,
<div><br>
</div>
<div>I have two servers - one is HP Proliant DL580G5 with 32 cores and other is Hp server with 24 cores. I want to cluster these two with 32 nodes one as the master. Finally I need to use the computational powers of both in gromacs (MD simulation software)
 using mpi. So, what I want to know is how can I cluster them. If any could be help me out in this, it will be of great help...</div>
<div><br>
</div>
<div>Regards<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
Bharat<br>
<br>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>

</div>

<br>_______________________________________________<br>
mpich-discuss mailing list     <a href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov">mpich-discuss@mcs.anl.gov</a><br>
To manage subscription options or unsubscribe:<br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich-discuss" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich-discuss</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Bharat<br>Ph.D. Candidate<br>Room No. : 7202A, 2nd Floor<br>Biomolecular Engineering Laboratory<br>Division of Chemical Engineering and Polymer Science<br>
Pusan National University<br>Busan -609735<br>South Korea<br>Lab phone no. - +82-51-510-3680, +82-51-583-8343<div>Mobile no. - 010-5818-3680<br>E-mail : <a href="mailto:monu46010@yahoo.com" target="_blank">monu46010@yahoo.com</a></div>
<br>
</div>