<font face="comic sans ms,sans-serif">This is the o/p with <br></font><br>/home/balaji/mpich2-install/bin/mpicc -mpe=mpilog -o homb.ex -O3 -show -fopenmp src/homb.<br><div class="im"><br></div> output:<br><font face="comic sans ms,sans-serif">gcc -I/home/balaji/mpich2-install/include -Wl,--export-dynamic -o homb.ex -O3 -fopenmp src/homb.c -lm -I/home/balaji/mpich2-install/include -L/home/balaji/mpich2-install/lib -L/home/balaji/mpich2-install/lib -llmpe -lmpe -lmpich -lopa -lmpl -lrt -lpthread<br>

<br></font><br><div class="gmail_quote">On Fri, Mar 2, 2012 at 9:14 AM, Anthony Chan <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<br>
add -show to the command and send me the output.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
----- Original Message -----<br>
&gt; /home/balaji/mpich2-install/bin/mpicc -mpe=mpilog -o homb.ex -O3<br>
&gt; -fopenmp<br>
&gt; src/homb.c<br>
&gt;<br>
&gt; It still doesnt work. But no errors<br>
&gt;<br>
&gt; On Tue, Feb 28, 2012 at 11:52 PM, Anthony Chan &lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;<br>
&gt; wrote:<br>
&gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; mpicc in your path is still mpich2, but it is likely an older<br>
&gt; &gt; version, do /usr/bin/mpich2version for the version.<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; The mpich2-1.4 that you just built is installed in<br>
&gt; &gt; /home/balaji/mpich2-install.<br>
&gt; &gt; Link your MPI benchmark using fullpath to mpicc as follows<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; /home/balaji/mpich2-install/bin/mpicc -mpe=mpilog -o homb.ex -O3<br>
&gt; &gt; -fopenmp<br>
&gt; &gt; src/homb.c<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; A.Chan<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; ----- Original Message -----<br>
&gt; &gt; &gt; which mpicc gives<br>
&gt; &gt; &gt; /usr/bin/mpicc<br>
&gt; &gt; &gt; while mpicc -show gives,<br>
&gt; &gt; &gt; gcc -g -O2 -g -Wall -O2 -Wl,-Bsymbolic-functions<br>
&gt; &gt; &gt; -I/usr/include/mpich2<br>
&gt; &gt; &gt; -L/usr/lib -L/usr/lib -lmpich -lopa -lpthread -lrt<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; On Tue, Feb 28, 2012 at 11:55 AM, Anthony Chan &lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; MPICH2 does not have -lmpi. Do you have mpicc from<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; other MPI implementation (e.g. OpenMPI) on your path,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; What is the output of &quot;which mpicc&quot; ? Also, add -show<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; to your mpicc command and let us know the output ?<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; A.Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; ----- Original Message -----<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; I gave<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpicc -mpe=mpilog -o homb.ex -O3 -fopenmp -lmpi src/homb.c<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; while i compiled HOMB benchmark. Please note i don get any<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; errors,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; just<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; that i did not get the .clog2 files.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Tue, Feb 28, 2012 at 10:12 PM, Anthony Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Your installation of mpich2 seems OK. Don&#39;t see any error<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; though (your mpich2 isn&#39;t the latest). Also, don&#39;t move<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; around any files from &lt;mpich2-install-dir&gt;/etc.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; How do you compile and link with your MPI benchmark ?<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; A.Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; ----- Original Message -----<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; I have attached all files,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; as specified in the readme file,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpich2-1.4/c.txt (generated in step 1(d) above)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpich2-1.4/m.txt (generated in step 1(e) above)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpich2-1.4/mi.txt (generated in step 1(f) above)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpich2-1.4/config.log (generated in step 1(d) above)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; mpich2-1.4/src/openpa/config.log (generated in step 1(d)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; above)<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; And Btw, mpicc and mpirun works fine for me...<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Sun, Feb 26, 2012 at 3:18 AM, Anthony Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; It seems something may have gone wrong in your<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; installation.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Send us configure and make outputs as stated in the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; README<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; file.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; ----- Original Message -----<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; I copied the mpe_mpilog.conf from mpich2-install/etc<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; to<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; /etc/mpich2<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Now i<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; get no error. But When after executing, where will i<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; get<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; my<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; clog2<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; file? Its<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; not ther in the current directory.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Sat, Feb 25, 2012 at 11:52 PM, Balaji S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &lt;<a href="mailto:balaji.ceg.13@gmail.com">balaji.ceg.13@gmail.com</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Sir , When i gave &quot;-mpe=mpilog&quot; i get<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Profiling configuration file mpe_mpilog.conf not<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; found<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; in<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; /etc/mpich2<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Sat, Feb 25, 2012 at 11:41 PM, Anthony Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &lt;<a href="mailto:chan@mcs.anl.gov">chan@mcs.anl.gov</a>&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; wrote:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; For MPICH2 and MVAPICH2, link the benchmark with<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &quot;mpicc -mpe=mpilog&quot; or &quot;mpif90 -mpe=mpilog&quot;. For<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; OpenMPI, build standalone MPE for it and link the<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; benchmark with &quot;mpecc -mpilog&quot; or &quot;mpefc -mpilog&quot;.<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; A.Chan<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; ----- Original Message -----<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; Can anyone help me on how to create a &quot;.clog2&quot;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; file<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; from<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; an<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; MPI<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; benchmark?<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; Balaji.S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; _______________________________________________<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; mpich-discuss mailing list<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; <a href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov">mpich-discuss@mcs.anl.gov</a><br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt; To manage subscription options or unsubscribe:<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; &gt;<br>
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&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; _______________________________________________<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; mpich-discuss mailing list<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt; <a href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov">mpich-discuss@mcs.anl.gov</a><br>
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&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;&gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;     Balaji.S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Balaji.S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Balaji.S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Balaji.S<br>
&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; --<br>
&gt; &gt; &gt; With Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; Balaji.S<br>
&gt; &gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; With Regards,<br>
&gt; Balaji.S<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>With Regards,<br>    Balaji.S<br><div style="padding:0px;margin-left:0px;margin-top:0px;overflow:hidden;word-wrap:break-word;color:black;font-size:10px;text-align:left;line-height:130%">

</div><br>