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<body class='hmmessage'>
Hi, Jayesh,<br><br>I was trying the new 1.08p1 version of MPICH2 on Windows Vista64. I heard from you that we need <font style="" color="#0000ff" face="Arial"> the gcc libs, *.a,&nbsp;with 64-bit version</font><br>Could you please send a copy of that to me or somehow make it available online?<br><br>Many thanks for your help!<br><br>Ting<br><br><hr id="stopSpelling">From: leitingl@hotmail.com<br>To: jayesh@mcs.anl.gov<br>Date: Tue, 6 Jan 2009 11:45:21 +0000<br>CC: mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>Subject: Re: [mpich-discuss] question regarding compiling/linking under MingW (MPICH2 1.08)<br><br>



<style>
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</style>


Hi, Jayesh,<br>
&nbsp;<br>
Thanks a lot for your reply. Solution 1) works well&nbsp;on the Win64 machine.<br>
"<br>
<font color="#0000ff" face="Arial">However we don't ship the gcc libs, *.a,&nbsp;with 64-bit version of MPICH2. Let me know if you need them.). </font><br>"<br>
also, could you please make the gcc libs *.a available somehow?<br>
&nbsp;<br>
I didn't try cygwin because I heard about comflicts with mingw dll's, and also about the performance cost of using cygwin vs. mingw. But it's only rumors, I don't really know if there is any big performance impact. Currently, I am happy with MPICH2+mingw working.<br>
&nbsp;<br>
Many thanks for your help<br>
&nbsp;<br>
T.<br><br>

<hr id="EC_stopSpelling">
<br>
From: jayesh@mcs.anl.gov<br>To: leitingl@hotmail.com<br>CC: mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>Subject: RE: [mpich-discuss] question regarding compiling/linking under MingW (MPICH2 1.08)<br>Date: Mon, 5 Jan 2009 16:55:15 -0600<br><br><br>
<style>
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<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">Hi,</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">&nbsp;Glad to know MPICH2+MingW is working for you in 32-bit windows.</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">&nbsp;There are two ways to fix your problem with MPICH2+MingW on 64-bit windows,</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">1) Use 32-bit version of MPICH2 on your 64-bit windows machine (Uninstall any 64-bit version of MPICH2 before you install 32-bit version of MPICH2). AFAIK Cygwin distributions are 32-bit and we provide default support for Cygwin+gcc on 32-bit platforms only.</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">2) Let us know if you want to build 64-bit binaries using MPICH2+MingW (The defns for windows fixed width ints - __int* - is in _mingw.h, which is included by all MingW header files. So include &lt;sys/types.h&gt; before including "mpi.h" and you should be able to get rid of errors with undefined MS-extended types. However we don't ship the gcc libs, *.a,&nbsp;with 64-bit version of MPICH2. Let me know if you need them.). </span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">&nbsp;If you want to compile MPICH2 on&nbsp;windows (without using Visual Studio compiler)&nbsp;try compiling MPICH2 using Cygwin. Let us know if it works for you (We regularly test MPICH2+Cygwin. You won't have the problem with unsupported poll() if you use Cygwin - Cygwin libs do the abstraction for you.).</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">&nbsp;Let us know the results.</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">Regards,</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" face="Arial"><span class="EC_EC_049304215-05012009">Jayesh</span></font></div><br>
<div class="EC_EC_OutlookMessageHeader" dir="ltr" align="left" lang="en-us">
<hr>
<font face="Tahoma"><b>From:</b> mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov [mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov] <b>On Behalf Of </b>ting lei<br><b>Sent:</b> Sunday, January 04, 2009 5:46 PM<br><b>To:</b> mpich-discuss@mcs.anl.gov<br><b>Subject:</b> Re: [mpich-discuss] question regarding compiling/linking under MingW (MPICH2 1.08)<br></font><br></div>
<div></div>Hi,<br>&nbsp;<br>Thanks a lot for your reply. <br>I just read an infinitely long post that discusses whether __int64 is dead, and realized that I get into something taboo regarding ms specific vs c99.&nbsp;<br>There is&nbsp;a lot of discussion of aethetics there, ..., to no avail though.<br>&nbsp;<br>Just for the sake of the problem, I used the binary distribution for Win64. Below is my MPICH2/lib&nbsp; <br>$ ls /c/MPICH2/lib/<br>TraceInput.lib&nbsp; fmpe.lib&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; irlog2rlog.lib&nbsp; mpi.lib<br>cxx.lib&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; fmpich2.lib&nbsp; mpe.lib&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; rlog.lib<br>&nbsp;<br>In the win32 version, I did see libmpi.a in the same folder. But I tried removing that file, and was able to compile and link.<br>&nbsp;<br>My last effort was to use&nbsp;&nbsp; <br>typedef long long MPI_Aint<br>and go back to mingw+gcc3.4.5+vista64, and the error message was:<br>&nbsp;<br>$ gcc -I /c/MPICH2/include/ test.c -L /c/MPICH2/lib/ -lmpi&nbsp; <br>C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/cciBiEaP.o:test.c:(.text+0x38): undefined reference to `MPI_Init'<br>C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/cciBiEaP.o:test.c:(.text+0x4b): undefined reference to `MPI_Comm_rank'<br>collect2: ld returned 1 exit status<br>&nbsp;<br>As a side note, I tried to compile one from source using mingw under Win64, <br>but it was complaining about missing poll() function etc. Somebody complained in a MingW list, but a mingw person believes that MPI under windows shouldn't<br>use poll() anyways. I tried to add some other code downloaded from the internet that fakes a poll(), then I got a problem with threads. And I realized that the job is<br>beyond a novice like me.<br>&nbsp;<br>Thanks again for your help,<br>hope some day this problem will disappear. But maybe the mingw idea was wrong -- a minimal set of unix functions with native winxx impl. Lovely little piece that brings <br>unix to the dull windows command line though.<br>&nbsp;<br>&nbsp;<br>T.<br><br><br><br>&gt; Date: Sun, 4 Jan 2009 20:21:42 +0100<br>&gt; From: ddkrause@uni-bonn.de<br>&gt; To: mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>&gt; Subject: Re: [mpich-discuss] question regarding compiling/linking under MingW (MPICH2 1.08)<br>&gt; <br>&gt; Hi,<br>&gt; <br>&gt; ting lei wrote:<br>&gt; &gt; *Hi, Dorian*<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Thanks a lot for your prompt reply.<br>&gt; &gt; Your command line<br>&gt; &gt; &gt; gcc -I /c/MPICH2/include/ test.c -L/c/MPICH2/lib/ -lmpi<br>&gt; &gt; solves the first problem perfectly on win32.<br>&gt; <br>&gt; Good to hear.<br>&gt; <br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; On Win64, I see the following from line 333 onwards about MPI_Aint<br>&gt; &gt; "<br>&gt; &gt; /* Definitions that are determined by configure. */<br>&gt; &gt; typedef __int64 MPI_Aint;<br>&gt; &gt; typedef int MPI_Fint;<br>&gt; &gt; #define MPI_AINT_FMT_DEC_SPEC "%I64d"<br>&gt; &gt; #define MPI_AINT_FMT_HEX_SPEC "%I64x"<br>&gt; &gt; "<br>&gt; &gt; It seems that configure made a choice of __int64 for the Win64 package <br>&gt; &gt; instead of long under linux. Any idea how this might be solved?<br>&gt; &gt; I have also attached the output with the -E option in the attachment <br>&gt; &gt; err.txt for your reference.<br>&gt; &gt; BTW, I tried to manually change<br>&gt; &gt; typedef __int64 MPI_Aint;<br>&gt; &gt; to<br>&gt; &gt; typedef long MPI_Aint;<br>&gt; &gt; and then, I got:<br>&gt; &gt; gcc -I /c/MPICH2/include/ test.c -L /c/MPICH2/lib/ -lmpi <br>&gt; &gt; test.c: In function 'main':<br>&gt; &gt; test.c:15: warning: incompatible implicit declaration of built-in <br>&gt; &gt; function 'printf'<br>&gt; &gt; C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/ccsAr9gj.o:test.c:(.text+0x22): <br>&gt; &gt; undefined reference to `_MPI_Init'<br>&gt; &gt; C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/ccsAr9gj.o:test.c:(.text+0x36): <br>&gt; &gt; undefined reference to `_MPI_Comm_rank'<br>&gt; &gt; collect2: ld returned 1 exit status<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; or the following for using g++:<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; $ g++ -I /c/MPICH2/include/ test.c -L /c/MPICH2/lib/ -lmpi<br>&gt; &gt; C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/ccPO9opx.o:test.c:(.text+0x22): <br>&gt; &gt; undefined reference to `_MPI_Init'<br>&gt; &gt; C:/Users/ting/AppData/Local/Temp/ccPO9opx.o:test.c:(.text+0x36): <br>&gt; &gt; undefined reference to `_MPI_Comm_rank'<br>&gt; &gt; collect2: ld returned 1 exit status<br>&gt; &gt;<br>&gt; <br>&gt; You said that you downloaded the binary distribution, correct? I have no <br>&gt; experiences with MPICH2 on Windows<br>&gt; but I would suspect that the libraries were build with Microsofts C/C++ <br>&gt; compiler cl and on Win64 the MingGW gcc<br>&gt; compiler and cl are not compatible. __int64 is a Microsoft specific <br>&gt; extension to C/C++ (http://msdn.microsoft.com/en-us/library/29dh1w7z.aspx).<br>&gt; Also it seems that gcc does some sort of name-mangling (adding an <br>&gt; underscore to the function name). This is rather strange<br>&gt; for a C compiler...<br>&gt; <br>&gt; Probably you'r right that its a gcc 4.3 issue. Maybe some else has more <br>&gt; insight into this.<br>&gt; <br>&gt; Interestingly he doesn't say that he can't find libmpi.a. Are you sure <br>&gt; that it is not there?<br>&gt; <br>&gt; BTW: typedef long MPI_Aint might be a problem because sizeof(long) = 4 <br>&gt; on Windows at least with the Microsoft compiler. Don't know what<br>&gt; gcc does in this situation.<br>&gt; <br>&gt; Dorian<br>&gt; <br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Thanks again.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; T.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Date: Sun, 4 Jan 2009 18:29:23 +0100<br>&gt; &gt; &gt; From: ddkrause@uni-bonn.de<br>&gt; &gt; &gt; To: mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>&gt; &gt; &gt; Subject: Re: [mpich-discuss] question regarding compiling/linking <br>&gt; &gt; under MingW (MPICH2 1.08)<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Hi<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; ting lei wrote:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Hi,<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Sorry to bother all. I have some questions regarding using MPICH2 <br>&gt; &gt; 1.08<br>&gt; &gt; &gt; &gt; with MingW<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; I tried compile MPICH2 1.08 on two different machines, and have met<br>&gt; &gt; &gt; &gt; different problems. I was wondering if someone with a lot experience<br>&gt; &gt; &gt; &gt; could help me out here. thanks in advance.<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; 1) The most successful attempt was on a win32 platform, XPSP3 with<br>&gt; &gt; &gt; &gt; MingW+gcc3.4.5<br>&gt; &gt; &gt; &gt; The command line I used was:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; gcc -I /c/MPICH2/include/ -lmpi -L/c/MPICH2/lib/ test.c<br>&gt; &gt; &gt; &gt; and I get the following error:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; C:/DOCUME~1/ting/LOCALS~1/Temp/cc40AD3K.o:test.c:(.text+0x38):<br>&gt; &gt; &gt; &gt; undefined reference to `MPI_Init'<br>&gt; &gt; &gt; &gt; C:/DOCUME~1/ting/LOCALS~1/Temp/cc40AD3K.o:test.c:(.text+0x4b):<br>&gt; &gt; &gt; &gt; undefined reference to `MPI_Comm_rank'<br>&gt; &gt; &gt; &gt; collect2: ld returned 1 exit status<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Could you try<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; gcc -I /c/MPICH2/include/ test.c -L/c/MPICH2/lib/ -lmpi<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Since your testprogram depends on the mpi library you need to specify<br>&gt; &gt; &gt; the library after your program because the linker goes from left to <br>&gt; &gt; right.<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; It seems that the library file libmpi.a is corrected specified,<br>&gt; &gt; &gt; &gt; because if I change it to -lmpi1 it will report<br>&gt; &gt; &gt; &gt; c:\mingw\bin\..\lib\gcc\mingw32\3.4.5\..\..\..\..\mingw32\bin\ld.exe:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; cannot find -lmpi1<br>&gt; &gt; &gt; &gt; collect2: ld returned 1 exit status<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; 2) My less successful attempt was on a Win64 (Vista64) platform with<br>&gt; &gt; &gt; &gt; MingW + gcc4.3:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; I tried installing the mpich2-1.0.8-win-x86-64.msi. but<br>&gt; &gt; &gt; &gt; a) after the installation, I couldn't find libmpi.a in MPICH2\lib<br>&gt; &gt; &gt; &gt; folder as I was able to in case 1).b) when I am compiling the toy <br>&gt; &gt; test<br>&gt; &gt; &gt; &gt; program, I get many errors like this:<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; In file included from test.c:1:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; c:/MPICH2/include/mpi.h:334: error: expected '=', ',', ';', 'asm' or<br>&gt; &gt; &gt; &gt; '__attribute__' before 'MPI_Aint'<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Is this a gcc4.x problem?<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Did you take a look at mpi.h line 334? On Linux I can see typedef long<br>&gt; &gt; &gt; MPI_Aint; . Could you compile with the -E flag to see the preprocessor<br>&gt; &gt; &gt; output? Maybe something is overwriting long?<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Best<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; T<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; <br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; &gt; &gt; From: jayesh@mcs.anl.gov<br>&gt; &gt; &gt; &gt; To: leitingl@hotmail.com<br>&gt; &gt; &gt; &gt; CC: mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Subject: RE: [mpich-discuss] (no subject) - mingw<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Date: Tue, 2 Dec 2008 13:34:18 -0600<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Hi,<br>&gt; &gt; &gt; &gt; You could try installing MPICH2 on windows (from the installer<br>&gt; &gt; &gt; &gt; available at<br>&gt; &gt; &gt; &gt; <br>&gt; &gt; http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/index.php?s=downloads) <br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; and compile your code and link with the gcc libs (*.a) provided with<br>&gt; &gt; &gt; &gt; the installation (MPICH2\lib directory).<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Regards,<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Jayesh<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; <br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; &gt; &gt; *From:* mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov<br>&gt; &gt; &gt; &gt; [mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov] *On Behalf Of *ting lei<br>&gt; &gt; &gt; &gt; *Sent:* Tuesday, December 02, 2008 1:31 PM<br>&gt; &gt; &gt; &gt; *To:* mpich-discuss@mcs.anl.gov<br>&gt; &gt; &gt; &gt; *Subject:* [mpich-discuss] (no subject)<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Hi,<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; This might be a newbie question.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; I see in this thread that people can compile MPICH2 with MingW. I <br>&gt; &gt; tried that with MingW (gcc 4.3 and 3.4x) several times but<br>&gt; &gt; &gt; &gt; I was never able to get past the ./configure step.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; /"I have compiled a C executable using the MPICH2 Windows <br>&gt; &gt; libraries and //MinGW./"<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Could someone please give me some pointers how to compile such an <br>&gt; &gt; executable?<br>&gt; &gt; &gt; &gt; More specifically, do I have to compile MPICH2 itself from source <br>&gt; &gt; using MinGW then use some program such as mpicc??<br>&gt; &gt; &gt; &gt; or should I just compile a regular c program and run it with <br>&gt; &gt; mpiexec.exe ?<br>&gt; &gt; &gt; &gt; If I were to compile MPICH2 itself with MingW, what other packages <br>&gt; &gt; do I need except the latest version of MingW?<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Many thanks for your help<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &lt;http://clk.atdmt.com/MRT/go/127032869/direct/01/&gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; <br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; &gt; &gt; It’s the same Hotmail®. If by “same” you mean up to 70% faster. Get<br>&gt; &gt; &gt; &gt; your account now.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; <br>&gt; &gt; &lt;http://windowslive.com/online/hotmail?ocid=TXT_TAGLM_WL_hotmail_acq_broad1_122008&gt;<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; Send e-mail faster without improving your typing skills. Get your <br>&gt; &gt; Hotmail® account. <br>&gt; &gt; &lt;http://windowslive.com/online/hotmail?ocid=TXT_TAGLM_WL_hotmail_acq_speed_122008&gt;<br>&gt; <br><br><br>
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