<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16809" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><FONT 
face="Times New Roman"><FONT color=#000000><FONT size=3><SPAN 
class=928383418-25022009>&gt; </SPAN>On a sidenote, how do I reply to the 
thread? I only get the daily digest in 
mail.</FONT></FONT></FONT><BR></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=928383418-25022009><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>You can change you subscription options&nbsp;at <A 
href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich-discuss">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/mpich-discuss</A>&nbsp;to 
receive each mail separately instead of a digest version.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=928383418-25022009><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=928383418-25022009><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>Rajeev</FONT></SPAN></DIV><BR>
<BLOCKQUOTE dir=ltr 
style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #0000ff 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left>
  <HR tabIndex=-1>
  <FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov 
  [mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov] <B>On Behalf Of </B>Gauri 
  Kulkarni<BR><B>Sent:</B> Wednesday, February 25, 2009 6:04 AM<BR><B>To:</B> 
  mpich-discuss@mcs.anl.gov<BR><B>Subject:</B> Re: [mpich-discuss] HP-XC 3000 
  cluster issues<BR></FONT><BR></DIV>
  <DIV></DIV>Thanks, Rajeev.<BR><BR>Is it the same case with MPICH1? The reason 
  I need info about MPICH1 with SLURM is because we have a software (FastDL) 
  which has been compiled with MPICH1. We have asked the vendor to give us the 
  software recompiled with MPICH2, but honestly, we do not know any particular 
  advantage using MPICH2 over MPICH1 (apart from the fact that MPICH1 isn't 
  maintained anymore).<BR><BR>On a sidenote, how do I reply to the thread? I 
  only get the daily digest in 
  mail.<BR><BR>-Gauri.<BR>----------<BR><BR><BR><BR>-------------<BR><BR>Message: 
  4<BR>Date: Mon, 23 Feb 2009 23:38:06 -0600<BR>From: "Rajeev Thakur" &lt;<A 
  href="mailto:thakur@mcs.anl.gov">thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>Subject: Re: 
  [mpich-discuss] HP-XC 3000 cluster issues<BR>To: &lt;<A 
  href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov">mpich-discuss@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>Message-ID: 
  &lt;
  <DIV class="ArwC7c ckChnd" 
  id=:x4>72376B2D10EC43F9A0A433C960F951B6@thakurlaptop&gt;<BR>Content-Type: 
  text/plain; charset="us-ascii"<BR><BR>To run MPICH2 with SLURM, configure with 
  the options "--with-pmi=slurm<BR>--with-pm=no" as described in the MPICH2 
  README file. Also see the<BR>instructions on how to run MPICH2 with SLURM 
  at<BR><A href="https://computing.llnl.gov/linux/slurm/quickstart.html" 
  target=_blank>https://computing.llnl.gov/linux/slurm/quickstart.html</A> 
  .<BR><BR>Rajeev<BR><BR><BR><BR>&nbsp;_____<BR><BR>From: <A 
  href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov">mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A><BR>[mailto:<A 
  href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov">mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] 
  On Behalf Of Gauri Kulkarni<BR>Sent: Monday, February 23, 2009 11:19 PM<BR>To: 
  <A 
  href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov">mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR>Subject: 
  [mpich-discuss] HP-XC 3000 cluster issues<BR><BR><BR>Hi,<BR><BR>I am a newbie 
  to the MPI in general. Currently in our institute, we have a<BR>cluster of 
  16nodes-8processors. It is an HP-XC 3000 cluster which basically<BR>means, 
  it's quite proprietary. It has its own MPI implementation - HP-MPI -<BR>in 
  which, the parallelization is managed by SLURM (Simple Linux Utility 
  for<BR>Resource Management). There is also a batch job scheduler - LSF 
  (Load<BR>Sharing Facility) which works in tandem with SLURM to parallelize the 
  batch<BR>jobs. We have installed both MPICH and MPICH2 and are testing it, but 
  we are<BR>running into compatibility issues. For a simple helloworld.c 
  program:<BR>1. For HPMPI: Compiled with mpicc of this implemetation and 
  executed with<BR>its mpirun: mpirun -np 4 helloworld works correctly. For 
  batch scheduling,<BR>we need to isse "bsub -n4 [other options] mpirun -srun 
  helloworld" and it<BR>runs fine too. "srun" is SLURM utility that parallelizes 
  the jobs.<BR>2. For MPICH and mPICH2: Again, compiled with mpicc of these 
  respective<BR>implemetations and executed with their own mpirun:<BR>&nbsp; 
  &nbsp;i) mpirun -np 4 helloword : Works.<BR>&nbsp; ii) mpirun -np 15 
  helloworld: The parallelization is limited to just a<BR>single node - that is 
  8 processes run first on 8 processors of a single node<BR>and then remaining 
  ones.<BR>&nbsp;iii) bsub -n4 [options] mpirun -srun hellowrold: Job 
  terminated. srun<BR>option not recognized.<BR>&nbsp; iv) bsub [options] mpirun 
  -np 4 helloworld: Works<BR>&nbsp; V) bsub [options] mpirun -np 15 helloworld: 
  (Same as iii)<BR><BR>Anybody aware of HP cluster issues with MPICH? Am I 
  misinterpreting? Any<BR>help is 
appreciated.<BR><BR>Gauri.<BR>---------</DIV></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>