<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
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<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16735" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=109240605-30112008><FONT face=Arial 
color=#0000ff size=2>But you don't have 6 cores, do you?</FONT></SPAN></DIV><BR>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #0000ff 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left>
  <HR tabIndex=-1>
  <FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov 
  [mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov] <B>On Behalf Of </B>Waruna 
  Ranasinghe<BR><B>Sent:</B> Saturday, November 29, 2008 11:03 PM<BR><B>To:</B> 
  mpich-discuss@mcs.anl.gov<BR><B>Subject:</B> Re: [mpich-discuss] Clarification 
  needed on runningprocessesonMPICH2<BR></FONT><BR></DIV>
  <DIV></DIV>Yes, I'm sorry if you were miss led by my wordings.<BR>I meant 
  running two instances.<BR><BR>
  <DIV class=gmail_quote>2008/11/30 Rajeev Thakur <SPAN dir=ltr>&lt;<A 
  href="mailto:thakur@mcs.anl.gov">thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;</SPAN><BR>
  <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
  style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">
    <DIV>
    <DIV dir=ltr align=left><SPAN><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>If you 
    run two instances of mpiexec -n 3 tst, you are running a total of 6 
    processes, not 2 or 3.&nbsp;</FONT></SPAN></DIV>
    <DIV dir=ltr align=left><SPAN><FONT face=Arial color=#0000ff 
    size=2></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
    <DIV dir=ltr align=left><SPAN><FONT face=Arial color=#0000ff 
    size=2>Rajeev</FONT></SPAN></DIV><BR>
    <BLOCKQUOTE 
    style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: rgb(0,0,255) 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
      <DIV lang=en-us dir=ltr align=left>
      <HR>
      <FONT face=Tahoma size=2>
      <DIV class=Ih2E3d><B>From:</B> <A 
      href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
      target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A> [mailto:<A 
      href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
      target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] <B>On Behalf Of 
      </B>Waruna Ranasinghe<BR></DIV><B>Sent:</B> Saturday, November 29, 2008 
      5:38 AM
      <DIV>
      <DIV></DIV>
      <DIV class=Wj3C7c><BR><B>To:</B> <A 
      href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" 
      target=_blank>mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR><B>Subject:</B> Re: 
      [mpich-discuss] Clarification needed on 
      runningprocessesonMPICH2<BR></DIV></DIV></FONT><BR></DIV>
      <DIV>
      <DIV></DIV>
      <DIV class=Wj3C7c>
      <DIV></DIV>&gt;What do you mean by "one process" when it is clearly 
      3<BR>&gt;processes are running ? &nbsp;When you say 2 processes of 
      tst,<BR>&gt;do you mean you launched two instances of<BR>&gt;"mpiexec -n 3 
      ./tst" simultaneously.<BR><BR>Yes, I meant of launching two instances of 
      "mpiexec -n 3 ./tst" simultaneously.<BR><BR>I could not reach the MPICH 
      cluster until monday, so that I'll send the modified programme on 
      Monday.<BR><BR>Thank You,<BR>Waruna<BR><BR>
      <DIV class=gmail_quote>2008/11/29 Anthony Chan <SPAN dir=ltr>&lt;<A 
      href="mailto:chan@mcs.anl.gov" 
      target=_blank>chan@mcs.anl.gov</A>&gt;</SPAN><BR>
      <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
      style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">&gt;From 
        your Readme file:<BR><BR>&gt; mpiexec -n 3 &lt;path&gt;<BR>&gt;<BR>&gt; 
        output:<BR>&gt; when only one process runs<BR>&gt;<BR>&gt; 0:Total: 
        499999999500000000 : Time: 9.272023<BR>&gt; 2:Total: 499999999500000000 
        : Time: 10.722239<BR>&gt; 1:Total: 499999999500000000 : Time: 
        11.324907<BR>&gt;<BR>&gt; When two processes of 'tst' runs in the same 
        time<BR>&gt;<BR>&gt; 0:Total: 499999999500000000 : Time: 
        9.538206<BR>&gt; 2:Total: 499999999500000000 : Time: 16.045104<BR>&gt; 
        1:Total: 499999999500000000 : Time: 22.400754<BR><BR>What do you mean by 
        "one process" when it is clearly 3<BR>processes are running ? &nbsp;When 
        you say 2 processes of tst,<BR>do you mean you launched two instances 
        of<BR>"mpiexec -n 3 ./tst" simultaneously.<BR><BR>Could you add the 
        following lines to your tst.cpp<BR><BR>&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; 
        &nbsp;char host_name[ MPI_MAX_PROCESSOR_NAME ];<BR>&nbsp;&nbsp; &nbsp; 
        &nbsp; &nbsp;int &nbsp;namelen;<BR>&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; 
        &nbsp;MPI_Get_processor_name( host_name, &amp;namelen );<BR>&nbsp;&nbsp; 
        &nbsp; &nbsp; &nbsp;printf("rank %d running on %s\n", rank, 
        host_name);<BR><BR>before first fflush(stdout) to show the location of 
        each process.<BR>Rerun your experiments and let us know the 
        result.<BR><BR>Also, you can use MPI_Wtime() instead of Duration.cpp 
        that may<BR>simplify your test program.<BR>
        <DIV>
        <DIV></DIV>
        <DIV><BR>A.Chan<BR><BR>----- "Waruna Ranasinghe" &lt;<A 
        href="mailto:warunapww@gmail.com" 
        target=_blank>warunapww@gmail.com</A>&gt; wrote:<BR><BR>&gt; Hi 
        Rajeev,<BR>&gt; Here's test programme. It's just for testing. The 
        results I got, are<BR>&gt; in the<BR>&gt; read me file in the 
        attachment<BR>&gt;<BR>&gt; Thank You<BR>&gt; Waruna<BR>&gt;<BR>&gt; 
        2008/11/27 Rajeev Thakur &lt;<A href="mailto:thakur@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>&gt;<BR>&gt; &gt; &nbsp;In 
        that case, what kind of program are you running? Can you send us<BR>&gt; 
        a<BR>&gt; &gt; small test program.<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; 
        Rajeev<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; 
        &nbsp;------------------------------<BR>&gt; &gt; *From:* <A 
        href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A> [mailto:<BR>&gt; 
        &gt; <A href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] *On Behalf Of 
        *Waruna Ranasinghe<BR>&gt; &gt; *Sent:* Wednesday, November 26, 2008 
        9:05 PM<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; *To:* <A 
        href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR>&gt; &gt; *Subject:* Re: 
        [mpich-discuss] Clarification needed on<BR>&gt; &gt; 
        runningprocessesonMPICH2<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; Hi Rajeev,<BR>&gt; 
        &gt; There's no doubt that process runs on all 3 machines.<BR>&gt; &gt; 
        I have tried cpi example and it prints the hostnames of 3 
        machines<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; mpiexec -l -n 3 &lt;path to 
        process&gt;<BR>&gt; &gt; (the same path is available in all 3 
        machines)<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; Thank you<BR>&gt; &gt; 
        Waruna<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; 2008/11/26 Rajeev Thakur 
        &lt;<A href="mailto:thakur@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt; 
        &nbsp;Make sure the processes are actually running on the 3 
        machines.<BR>&gt; Try the<BR>&gt; &gt;&gt; cpi example in the examples 
        directory. It prints out the hostname.<BR>&gt; How are<BR>&gt; &gt;&gt; 
        you running the job?<BR>&gt; &gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt; Rajeev<BR>&gt; 
        &gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt; &nbsp;------------------------------<BR>&gt; 
        &gt;&gt; &nbsp;*From:* <A 
        href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A> [mailto:<BR>&gt; 
        &gt;&gt; <A href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] *On Behalf Of 
        *Waruna<BR>&gt; Ranasinghe<BR>&gt; &gt;&gt; *Sent:* Wednesday, November 
        26, 2008 11:07 AM<BR>&gt; &gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt; *To:* <A 
        href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR>&gt; &gt;&gt; *Subject:* 
        Re: [mpich-discuss] Clarification needed on running<BR>&gt; &gt;&gt; 
        processesonMPICH2<BR>&gt; &gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt; &nbsp; Fedora 8 - 
        MPICH2 one machine with core-2-duo - master<BR>&gt; &gt;&gt; two 
        machines with one core<BR>&gt; &gt;&gt; all together 3 nodes<BR>&gt; 
        &gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt; 2008/11/26 Rajeev Thakur &lt;<A 
        href="mailto:thakur@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; &nbsp;What kind of environment are you running on (how many 
        machines,<BR>&gt; how<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; many cores each)?<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; Rajeev<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; &nbsp;------------------------------<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; 
        &nbsp;*From:* <A href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A> [mailto:<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; <A href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] *On Behalf Of 
        *Waruna<BR>&gt; Ranasinghe<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; *Sent:* Wednesday, 
        November 26, 2008 2:15 AM<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; *To:* <A 
        href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR>&gt; &gt;&gt;&gt; 
        *Subject:* Re: [mpich-discuss] Clarification needed on running<BR>&gt; 
        processes<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; onMPICH2<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; &nbsp; Hi Anthony,<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; I'm sorry, in this 
        case I have to disagree with you.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; Because it is not 
        max(t1,t2) but t1+t2 (this is the real result I<BR>&gt; got)<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; I use fflush(stdout) also<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; What I think is that, Cluster runs two programmes 
        alternatively.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; i.e. Process A runs for a while (say 
        t3 seconds) then process B<BR>&gt; for<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; sometime and 
        so on.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; Therefore, ultimately both the processes 
        will run for t1+t2<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; Cluster: 
        MPICH2<BR>&gt; &gt;&gt;&gt; Fedora 8<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt; 2008/11/26 Anthony Chan &lt;<A 
        href="mailto:chan@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>chan@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; If process A and B are 
        launched by mpiexec, the time taken<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; by mpiexec 
        should be max(t1,t2) not t1 + t2. As Rajeev said,<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; calling fflush(stdout) after each printf() is the 
        fastest way<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; to get each process's stdout 
        printed to your console.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; A.Chan<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &nbsp;----- "Waruna 
        Ranasinghe" &lt;<A href="mailto:warunapww@gmail.com" 
        target=_blank>warunapww@gmail.com</A>&gt; wrote:<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Hi Rajeev,<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Actually this is not what I'm talking 
        about.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Say there are processes A and 
        B<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Process A utilize 100% of the cpu while 
        it runs. The answer<BR>&gt; will<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; appear 
        in<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; t1 seconds<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; Process B also utilize 100% of the cpu while it runs. The<BR>&gt; 
        answer will<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; appear<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; in t2 seconds<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; When I run both the process A and B 
        at the same time, The both<BR>&gt; answers<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; 
        will<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; appear in t1 + t2 seconds. where as I 
        want to get the Process<BR>&gt; A's<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; 
        answer<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; first. (Here Process A is submitted 
        before Process B)<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; Is there anything that I can do to make this happen.<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Thank You,<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; Waruna<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; 2008/11/26 Rajeev Thakur &lt;<A 
        href="mailto:thakur@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>thakur@mcs.anl.gov</A>&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; &nbsp;If you are refering to the 
        output of "printf", you can try<BR>&gt; adding<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; an<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; fflush(stdout) after the 
        printf. You don't have much control<BR>&gt; over<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; the order<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; in 
        which it is printed from different processes.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; Rajeev<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; 
        &nbsp;------------------------------<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; 
        *From:* <A href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A> [mailto:<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; <A 
        href="mailto:mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss-bounces@mcs.anl.gov</A>] *On Behalf Of 
        *Waruna<BR>&gt; Ranasinghe<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; *Sent:* 
        Tuesday, November 25, 2008 1:35 AM<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; 
        *To:* <A href="mailto:mpich-discuss@mcs.anl.gov" 
        target=_blank>mpich-discuss@mcs.anl.gov</A><BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; &gt; *Subject:* [mpich-discuss] Clarification needed on 
        running<BR>&gt; processes<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; on<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; MPICH2<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; 
        &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; Hi all,<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; &gt; I submitted 3 processes at the same time using mpiexec. 
        the<BR>&gt; results<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; of each<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; process appears only after all the processes 
        have finished.<BR>&gt; (I guess<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; 
        that<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; the way mpich schedule 
        it).<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; What if I want to get the result 
        of the process, which was<BR>&gt; submitted<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; first,<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; first. (like first in 
        first out).<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; 
        &gt; &gt; I use MPICH2 cluster in Fedora 8 (with mpd)<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; Thank 
        you.<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt; Waruna Ranasinghe<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;&gt; &gt; &gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; &gt;&gt;&gt;<BR>&gt; 
        &gt;&gt;<BR>&gt; 
    &gt;<BR></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>