<div dir="ltr">Does Moab have the machinery to write both mesh and simulation data?  Obviously I can write the mesh, but I'm wondering if I need to create my own writers for simulation data or do they already exist in moab?  Simulation data is just referring to fluid densities on the grid, etc...<div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>John</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 20, 2015 at 1:52 PM, Vijay S. Mahadevan <span dir="ltr"><<a href="mailto:vijay.m@gmail.com" target="_blank">vijay.m@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><p dir="ltr">You can directly output to vtk in serial or use mbconvert tool under bin directory in your installation to convert the format. </p>
<p dir="ltr">mbconvert test.h5m test.vtk</p>
<p dir="ltr">That should work for any files. If there are issues let us know. You can also look at all supported formats by running </p>
<p dir="ltr">mbconvert -l</p><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
<p dir="ltr">Vijay</p></font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5">
<div class="gmail_quote">On May 20, 2015 8:27 PM, "John Loverich" <<a href="mailto:john.loverich@gmail.com" target="_blank">john.loverich@gmail.com</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thanks Vijay, also is there a moab format for simulation results?  There is a moab mesh and it's natural to write out data (density for example) corresponding to grid elements (vertices or cell centers for example).  If there is a standard way of doing this, then one can get the commercial visualization tools (like tecplot) to support it.<div><br></div><div>John</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 19, 2015 at 9:24 AM, Vijay S. Mahadevan <span dir="ltr"><<a href="mailto:vijay.m@gmail.com" target="_blank">vijay.m@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span>> Hi all, sorry for sending to this address, but couldn't find the proper<br>
> place to send questions.<br>
<br>
</span>John, no need to apologize. This is the right place to send these questions.<br>
<span><br>
> Is there any visualization tool that supports the native Moab mesh format<br>
> (h5m)?<br>
<br>
</span>Both Paraview and Visit need to be built from source to visualize the<br>
native h5m MOAB format. There are some instructions in [1] but I'm<br>
unsure if this is outdated since we've not built the plugin on recent<br>
version I think.<br>
<br>
Paraview is a bit easier i.e., compile Paraview from source, configure<br>
MOAB using --with-vtk option and install it to a prefix, go to<br>
tools/vtkMOABReader and use the CMake configuration to specify both<br>
PARAVIEW_DIR and MOAB_DIR to compile the plugin. You can then load the<br>
plugin from Paraview and utilize it to natively visualize h5m files.<br>
<br>
We are planning to also make this workflow easier in the coming<br>
months. Rajeev, does CMB take care of this right now as it stands ?<br>
<br>
Vijay<br>
<br>
[1] <a href="http://sigma.mcs.anl.gov/moab/visualization-with-moab/" target="_blank">http://sigma.mcs.anl.gov/moab/visualization-with-moab/</a><br>
<div><div><br>
On Tue, May 19, 2015 at 10:09 AM, John Loverich <<a href="mailto:john.loverich@gmail.com" target="_blank">john.loverich@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hi all, sorry for sending to this address, but couldn't find the proper<br>
> place to send questions.<br>
><br>
> Is there any visualization tool that supports the native Moab mesh format<br>
> (h5m)?  It seems neither Paraview nor VisIt can read this format, though I<br>
> may be mistaken.  On top of that, I'm interested in a standard way to store<br>
> field data for a given Moab mesh.  Though Moab simply defines the mesh,<br>
> suppose I have electric field values stored in a different file linking to<br>
> the mesh file.  Obviously I can use vtk or some other format, but would<br>
> rather use the Moab HDF5 format directly if possible.<br>
><br>
> Thanks,<br>
><br>
> John<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>