<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hi Rajeev,<br>
You can use mbsize -p0 option<br>
This will load the file in parallel, but the printout will be mangled between processors, each processor will write its count (-p1 will resolve shared entities, too), -p2 will exchange a layer of ghost elements)<br>
<br>
so you can do something like this<br>
mpiexec -np 64 mbsize -p0  <file_name><br>
<br>
How many partitions do you have?<br>
<br>
Do you have partitions? (parallel partitions?)<br>
<br>
You can also modify HelloParMOAB example for you needs (harder)<br>
<br>
LoadPartial example can load only a few partitions, and write a smaller file, it can be run in serial<br>
<br>
Something like<br>
./LoadPartial <file_name> PARALLEL_PARTITION 0 1 5<br>
<br>
This will load only partitions 0, 1 and 5, in serial, and write a part.h5m file, for which you can do an mbsize in serial (if it is small enough)<br>
<br>
All these methods will ensure at least that you have a "readable" file .<br>
<br>
I think we need to modify mbsize to run better in parallel (for example, to gather all counts from each processor, for the owned entities) and print only once , something like HelloParMOAB<br>
<br>
Iulian<br>
<br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div style="direction: ltr;" id="divRpF130851"><font color="#000000" face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> moab-dev-bounces@mcs.anl.gov [moab-dev-bounces@mcs.anl.gov] on behalf of Rajeev Jain [jain@mcs.anl.gov]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 30, 2014 11:40 PM<br>
<b>To:</b> MOAB Dev<br>
<b>Subject:</b> [MOAB-dev] 137GB mesh file<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:lucida console,sans-serif; font-size:10pt">
<div class="" style="">I have an ABTR model (billions of hex elements, created by MeshKit/rgg) that is 137GB on fusion@ANL: </div>
<div class="" style=""></div>
<div class="" style="">/homes/jain/sigma/moab/lasso/meshkit/rgg/test/c_abtr_sh</div>
<div class="" style=""><br>
</div>
<div class="" style="color:rgb(0,0,0); font-size:13px; font-family:'lucida console',sans-serif; font-style:normal; background-color:transparent">
I'm unable to do mbsize on it -> any suggestions?</div>
<div class="" style="color:rgb(0,0,0); font-size:13px; font-family:'lucida console',sans-serif; font-style:normal; background-color:transparent">
Just want to make sure if this is a valid file, also want to know material/boundary sets contained in it.</div>
<div class="" style="color:rgb(0,0,0); font-size:13px; font-family:'lucida console',sans-serif; font-style:normal; background-color:transparent">
<br>
</div>
<div class="" style="color:rgb(0,0,0); font-size:13px; font-family:'lucida console',sans-serif; font-style:normal; background-color:transparent">
Rajeev</div>
<div class="" style=""><br class="" style="">
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>