Hi Vijay:<br><br>OK, I just removed all references to moabuse from <a href="http://configure.ac">configure.ac</a>. So if you pull and run autoconf again, things should be ok. <br><br>So, the idea was that these files would get copied into the install directory. I spoke to Iulian today and realized that I kind of screwed this up. The way it is set up now, the files will get copied into the build directory. You are correct that the write thing to do is create a Makefile.am and work with that. I am new to autoconf and made a lot of mistakes, so my hope is to just disable all of this until I can learn more.<br>

<br>My apologies.<br>Milad<br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 22, 2012 at 3:51 PM, Vijay S. Mahadevan <span dir="ltr"><<a href="mailto:vijay.m@gmail.com" target="_blank">vijay.m@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Milad,<br>
<br>
I still get the same configure error after pulling your latest<br>
changes. I now have a <a href="http://README.moabuse.in" target="_blank">README.moabuse.in</a> but looks like you need to<br>
update configure or add Makefile.am for the changes to take effect.<br>
<div class="im"><br>
config.status: error: cannot find input file: examples/moabuse/README.moabuse<br>
<br>
</div>[vijaysm@janus moab-dev] ls examples/moabuse/<br>
Makefile  Makefile.in  <a href="http://mberr.hpp.in" target="_blank">mberr.hpp.in</a>  <a href="http://moabuse1.cpp.in" target="_blank">moabuse1.cpp.in</a>  <a href="http://moabuse2.cpp.in" target="_blank">moabuse2.cpp.in</a><br>


<a href="http://moabuse3.cpp.in" target="_blank">moabuse3.cpp.in</a>  <a href="http://moabuse4.cpp.in" target="_blank">moabuse4.cpp.in</a>  <a href="http://README.moabuse.in" target="_blank">README.moabuse.in</a><br>
<br>
As Iulian pointed out, why are these configure time files anyway and<br>
not just sources that get compiled during make ? The hpp/cpp files<br>
dont need to be inspected during configure and it is unnecessary.<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Vijay<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Mon, Oct 22, 2012 at 2:52 PM, Milad Fatenejad <<a href="mailto:icksa1@gmail.com">icksa1@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hi Vijay:<br>
><br>
> Sorry, this was my fault. I just checked in a fix.<br>
><br>
> Milad<br>
><br>
><br>
> On Mon, Oct 22, 2012 at 2:37 PM, Vijay S. Mahadevan <<a href="mailto:vijay.m@gmail.com">vijay.m@gmail.com</a>><br>
> wrote:<br>
>><br>
>> While updating the repository to the latest version, I pulled and<br>
>> re-configured with the command below but the configure process gives<br>
>> an error message now and stops.<br>
>><br>
>> ./configure --prefix=/home/vijaysm/software/opt/moab<br>
>> --with-hdf5=/home/jain/hdf5-1.8.9 --disable-debug --enable-optimize<br>
>> --with-mpi=/soft/mvapich2/1.5.1p1/intel/11.1.059 --enable-mbcoupler<br>
>> --enable-mbpart --enable-mbsize<br>
>> --with-netcdf=/home/jain/lib/netcdf-4.1.2<br>
>> --with-zoltan=/home/jain/lib/Zoltan_v3.3<br>
>> --with-parmetis=/home/jain/ParMETIS3_1<br>
>> checking build system type... x86_64-unknown-linux-gnu<br>
>> ...<br>
>> ...<br>
>> config.status: creating examples/moabuse/Makefile<br>
>> config.status: creating examples/moabuse/README.moabuse<br>
>> config.status: error: cannot find input file:<br>
>> examples/moabuse/README.moabuse<br>
>> ------------------------<br>
>><br>
>> When I do an svn up again, I get<br>
>> Restored 'examples/moabuse/README.moabuse'.<br>
>><br>
>> Perhaps somewhere inside configure, the README file is being deleted<br>
>> (I checked Makefile.in and it is part of the Clean files). Also I dont<br>
>> understand the logic for adding a README file as part of the configure<br>
>> process. This seems to be static and a reconfigure wipes it out. Is<br>
>> there a <a href="http://README.moabuse.in" target="_blank">README.moabuse.in</a> that is not in the repository ? Let me know<br>
>> if you need config.log for more details.<br>
>><br>
>> Thanks,<br>
>> Vijay<br>
><br>
><br>
</div></div></blockquote></div><br>