<div dir="ltr">Now working on BG. Justin, can you push the latest genleaf with objlist on BG.</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 4:34 PM, Tim Armstrong <span dir="ltr"><<a href="mailto:tim.g.armstrong@gmail.com" target="_blank">tim.g.armstrong@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div>
<div dir="ltr">
<div>Hm, ok, interesting.  I'm surprised that the compiler/linker didn't kick up a fuss, but I guess it snuck by it somehow.<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
</font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
- Tim<br>
</font></span></div><div><div class="h5">
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 4:29 PM, Ketan Maheshwari <span dir="ltr">
<<a href="mailto:ketan@mcs.anl.gov" target="_blank">ketan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Justin caught 1 by copying all the .o files from FS into objfiles directory, no subdirs. Which lead to me adding -fPIC in Makefile. Later, I explicitly made the dir hierarchy mkdir -p objfiles/nab, pulled in respective .o files and built the
 .so with them. The invalid address was likely from one of the nab/*.o files (most likely molio.o) which got fixed.</div>
<div>
<div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 4:25 PM, Ketan Maheshwari <span dir="ltr">
<<a href="mailto:ketan@mcs.anl.gov" target="_blank">ketan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Two things:
<div><br>
</div>
<div>1. The nab module was not being compiled with -fPIC.</div>
<div>2. I did not use the object files from this module as they end up in a subdir and I was just saying objfiles/*.o instead of objfiles/*.o objfiles/nab/*.o.</div>
</div>
<div>
<div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 4:21 PM, Tim Armstrong <span dir="ltr">
<<a href="mailto:tim.g.armstrong@gmail.com" target="_blank">tim.g.armstrong@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<div dir="ltr">What was the diagnosis in the end?<br>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">
<div>On Thu, Jul 31, 2014 at 3:51 PM, Justin M Wozniak <span dir="ltr"><<a href="mailto:wozniak@mcs.anl.gov" target="_blank">wozniak@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
<div>
<div><br>
Oh good. <br>
<div>
<div><br>
On 07/31/2014 03:49 PM, Ketan Maheshwari wrote:<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">This has worked!
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Ketan</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 3:41 PM, Maheshwari, Ketan C. <span dir="ltr">
<<a href="mailto:ketan@mcs.anl.gov" target="_blank">ketan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<div dir="ltr">Fixed now.</div>
<div>
<div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2014 at 3:37 PM, Wozniak, Justin M. <span dir="ltr">
<<a href="mailto:wozniak@mcs.anl.gov" target="_blank">wozniak@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>On 07/31/2014 03:33 PM, Ketan Maheshwari wrote:<br>
><br>
> The make output shows things were compiled with<br>
> -fPIC: /homes/ketan/dock6/install/makedock.out<br>
<br>
</div>
I get:<br>
<div><br>
/usr/bin/ld: objfiles/molio.o: relocation R_X86_64_32 against<br>
`.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile<br>
with -fPIC<br>
objfiles/molio.o: could not read symbols: Bad value<br>
<br>
</div>
makedock.out contains:<br>
<br>
gcc -c -O3 -D_ANSI_SOURCE  molio.c<br>
<span><font color="#888888"><br>
--<br>
Justin M Wozniak<br>
<br>
</font></span></blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</blockquote>
<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
<span><font color="#888888"><span><font color="#888888">
<pre cols="72">-- 
Justin M Wozniak</pre>
</font></span></font></span></div>
<div><br>
_______________________________________________<br>
ExM-user mailing list<br>
<a href="mailto:ExM-user@lists.mcs.anl.gov" target="_blank">ExM-user@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/exm-user" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/exm-user</a><br>
<br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div></div></div>

</blockquote></div><br></div>