<div dir="ltr"><div>I don't have any particular insight into the cause of the segfault, I can help with the debugger though.<br><br>You need to point gdb at the tclsh that is being used by turbine (which is just a shell script).  You can locate the correct tclsh by looking at TCLSH in scripts/turbine-config.sh in the turbine install directory.<br>
<br></div>- TIm<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 29, 2014 at 10:00 AM, Ketan Maheshwari <span dir="ltr"><<a href="mailto:ketan@mcs.anl.gov" target="_blank">ketan@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>Trying to main-wrap DOCK 6.6 application for ATPESC, I get the build right (seems) but things fail at runtime giving segfault:</div>
<div><br></div><div><div>$ turbine -n 4 user-code.tcl</div>
<div><br></div><div>===================================================================================</div><div>=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES</div><div>=   EXIT CODE: 139</div><div>=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES</div>

<div>=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES</div><div>===================================================================================</div><div>YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault (signal 11)</div>

<div>This typically refers to a problem with your application.</div><div>Please see the FAQ page for debugging suggestions</div></div><div><br></div><div>This is on MCS machine. Any suggestion to debug this? I tried gdb but it gives:</div>

<div><br></div><div> "/nfs2/ketan/exm-install/turbine/bin/turbine": not in executable format: File format not recognized</div><div><br></div><div>With strace, I see some signs of missing files but not sure if that is the cause of segfault. Attached is the strace output of:</div>

<div><br></div><div>strace -o strace.out turbine -n 4 user-code.tcl<br></div><div><br></div><div>The code has some MPI and pthread elements but does not use them as far as I understand.</div><div><br></div><div>Thanks for any suggestions.</div>

<div><br></div><div>--</div><div>Ketan</div></div>
<br>_______________________________________________<br>
ExM-user mailing list<br>
<a href="mailto:ExM-user@lists.mcs.anl.gov">ExM-user@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/exm-user" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/exm-user</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>