<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Wadud,<br>
    <br>
    It looks like you are trying to run one of the NAS benchmark codes,
    which I believe are Fortran programs, right?<br>
    <br>
    This is due to a known "issue" with OpenMPI2 where the Fortran
    bindings are calling PMPI_ routines directly, bypassing Darshan's
    use of the MPI profiling interface (PMPI). Basically, Darshan is
    unable to intercept any MPI calls, including MPI_Init/Finalize which
    is where Darshan initializes its data structures and does the
    generation of the log file, respectively. No error is generated for
    the same reason: Darshan never initializes itself and doesn't think
    it should be instrumenting anything. If interested in more details,
    check out this github issue:
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="https://github.com/open-mpi/ompi/issues/3954">https://github.com/open-mpi/ompi/issues/3954</a><br>
    <br>
    Ignoring the philosophical question of whether the "issue" here lies
    with the MPI implementation or tools that use the MPI profiling
    interface (this issue affects all PMPI tools, not just Darshan),
    we've actually spent some time developing a workaround for this
    issue recently, so you are in luck!<br>
    <br>
    I have not gone through with making a pre-release version of Darshan
    with this workaround publicly available, though I really have been
    meaning to. I will definitely make sure to do that today, and will
    send an update to this mailing list when its ready so you (and
    others) are aware. So, you have a couple of options:<br>
    <br>
    1.) Wait for that pre-release to come out later this afternoon, or<br>
    2.) Check out the master branch of the Darshan git repo
    (<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://xgitlab.cels.anl.gov/darshan/darshan">https://xgitlab.cels.anl.gov/darshan/darshan</a>)<br>
    <br>
    Either should resolve the issue, but be sure to let us know if not.<br>
    <br>
    Thanks,<br>
    --Shane<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 10/31/2017 10:51 AM, Wadud Miah
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:AM4PR0501MB216110BBF49A164F62AD38A2C05E0@AM4PR0501MB2161.eurprd05.prod.outlook.com">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
      <style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
      <style type="text/css">.style1 {font-family: "Times New Roman";}</style>
      <div id="divtagdefaultwrapper"
style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;"
        dir="ltr">
        <p>Hi everyone,</p>
        <p><br>
        </p>
        <p>I built Darshan 3.1.4 with OpenMPI 2.0.2 and gcc 7.2.1 using
          the following configure flags:</p>
        <p><br>
        </p>
        <p><span>./configure --with-mem-align=8
            --with-log-path-by-env=DARSHAN_LOGPATH --with-jobid-env=NONE
            CC=mpicc --prefix=/usr/local/darshan-3.1.4-ompi</span></p>
        <p><br>
        </p>
        <p>I have also attached the config.log file. When I run my
          application with LD_PRELOAD, Darshan does not create any trace
          file and neither does it complain:</p>
        <p><br>
        </p>
        <div>[miahw@bedale bin]$ export DARSHAN_LOGPATH=.<br>
          [miahw@bedale bin]$
          LD_PRELOAD=/usr/local/darshan-3.1.4-ompi/lib/libdarshan.so
          mpirun -n 4 ./bt.A.4.mpi_io_full
          <br>
        </div>
        <div>[ ... lots of application output ... ]<br>
          <div>[miahw@bedale bin]$ ls<br>
            bt.A.4  bt.A.4.mpi_io_full  btio.full.out  inputbt.data<br>
          </div>
          <div><br>
          </div>
          <div>As you can see, there is no trace file in the current
            working directory. Any help will be greatly appreciated.
            <br>
          </div>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Thanks in advance,</div>
        <div>Wadud.<br>
        </div>
        <p><br>
        </p>
        <div id="Signature">
          <div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color:
            rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);
            font-family:
            Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"EmojiFont","Apple
            Color Emoji","Segoe UI
            Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI
            Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols;">
            <p>---------------------------------------<br>
            </p>
            <p>Dr. Wadud Miah</p>
            <p>Numerical Algorithms Group</p>
            <p><br>
            </p>
            <p><br>
            </p>
          </div>
        </div>
      </div>
      <br>
      <br>
      <p style="font-family: Verdana; font-size:10pt; color:#666666;"><b>Disclaimer</b></p>
      <p style="font-family: Verdana; font-size:8pt; color:#666666;">The
        Numerical Algorithms Group Ltd is a company registered in
        England and Wales with company number 1249803. The registered
        office is:
        Wilkinson House, Jordan Hill Road, Oxford OX2 8DR, United
        Kingdom.<br>
        <br>
        This e-mail has been scanned for all viruses and malware, and
        may have been automatically archived by Mimecast Ltd, an
        innovator in Software as a Service (SaaS) for business.</p>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Darshan-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Darshan-users@lists.mcs.anl.gov">Darshan-users@lists.mcs.anl.gov</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>