<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix">Hi Wadud,<br>
      <br>
      For most (but not all) MPI implementations you wouldn't even need
      to use mpirun.  You can just launch the program like you normally
      would with ./app.exe and the MPI library will assume that it is
      operating in a single-process environment.<br>
      <br>
      -Phil<br>
      <br>
      On 12/14/2016 11:02 AM, Wadud Miah wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:AM4PR0501MB2707E9313A1011E70B796BDAC09A0@AM4PR0501MB2707.eurprd05.prod.outlook.com"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]-->
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Consolas;
        panose-1:2 11 6 9 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:black;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
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a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
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p
        {mso-style-priority:99;
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        {mso-style-priority:99;
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p.msonormal0, li.msonormal0, div.msonormal0
        {mso-style-name:msonormal;
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        {mso-style-type:personal;
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        {mso-style-name:"HTML Preformatted Char";
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</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext">Hi Shane,<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext"><o:p> </o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext">Thanks for
            the quick reply. I will probably just enclose the sequential
            code using MPI_INIT() and MPI_FINALIZE() and execute it
            using mpirun -n 1 ./app.exe. Do you think that will work?<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext"><o:p> </o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext">Regards,<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext">Wadud.<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:windowtext"><o:p> </o:p></span></p>
        <div>
          <div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1
            1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
            <p class="MsoNormal"><b><span
                  style="color:windowtext;mso-fareast-language:EN-GB"
                  lang="EN-US">From:</span></b><span
                style="color:windowtext;mso-fareast-language:EN-GB"
                lang="EN-US"> Shane Snyder [<a class="moz-txt-link-freetext" href="mailto:ssnyder@mcs.anl.gov">mailto:ssnyder@mcs.anl.gov</a>]
                <br>
                <b>Sent:</b> 14 December 2016 15:57<br>
                <b>To:</b> Wadud Miah <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:wadud.miah@nag.co.uk"><wadud.miah@nag.co.uk></a>;
                <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:darshan-users@lists.mcs.anl.gov">darshan-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
                <b>Subject:</b> Re: [Darshan-users] Darshan I/O
                profiling of sequential code<o:p></o:p></span></p>
          </div>
        </div>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt">Hi Wadud,<br>
          <br>
          Right now, Darshan can only instrument MPI applications. It
          intercepts MPI_Init and MPI_Finalize to initialize itself and
          to produce the output log file, respectively. It also uses MPI
          communication and I/O operations at shutdown time to aggregate
          data across all processes and write to the log file. Breaking
          the MPI dependencies isn't exactly straightforward, but we
          have at least been thinking about how to extend Darshan to
          non-MPI codes. Recent changes to the architecture have been a
          step in the right direction but there's still work to do to
          get us all the way there.<br>
          <br>
          We will continue to think about this and will certainly keep
          the mailing list updated with any progress we make.<br>
          <br>
          Thanks,<br>
          --Shane<span
            style="font-size:12.0pt;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p></o:p></span></p>
        <div>
          <p class="MsoNormal">On 12/14/2016 09:35 AM, Wadud Miah wrote:<o:p></o:p></p>
        </div>
        <blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
          <p class="MsoNormal">Hello,<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">I have built Darshan using Intel MPI
            (2017) and would like to profile a sequential code using
            Darshan. I have used the same Darshan library to profile an
            MPI code it works fine. I execute the following command line
            for a sequential code :<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">$ export DARSHAN_LOGPATH=.<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">$
            LD_PRELOAD=/home/pr1ebt00/pr1ebt05/darshan-3.1.2-impi/lib/libdarshan.so
            ~/gbmoldd/utilities/joinfiles.exe<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">but it doesn’t create any Darshan output
            file. Do you know if I can profile sequential codes using
            Darshan? If so, how can I do this?
            <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">Best regards,<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal">Wadud.<o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">-----------------------------------</span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">Dr.
              Wadud Miah</span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">Computational
              Scientist</span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">Numerical
              Algorithms Group</span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">01865
              518035</span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB"> </span><o:p></o:p></p>
          <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
          <div class="MsoNormal" style="text-align:center"
            align="center"><span
              style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New
              Roman",serif;mso-fareast-language:EN-GB">
              <hr align="center" size="2" width="100%">
            </span></div>
          <p>The Numerical Algorithms Group Ltd is a company registered
            in England and Wales with company number 1249803. The
            registered office is:<o:p></o:p></p>
          <p>Wilkinson House, Jordan Hill Road, Oxford OX2 8DR, United
            Kingdom.<o:p></o:p></p>
          <p> <o:p></o:p></p>
          <p>This e-mail has been scanned for all viruses by Microsoft
            Office 365. <o:p></o:p></p>
          <div class="MsoNormal" style="text-align:center"
            align="center"><span
              style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New
              Roman",serif;mso-fareast-language:EN-GB">
              <hr align="center" size="2" width="100%">
            </span></div>
          <p class="MsoNormal"><span
              style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New
              Roman",serif;mso-fareast-language:EN-GB"><br>
              <br>
              <br>
              <o:p></o:p></span></p>
          <pre>_______________________________________________<o:p></o:p></pre>
          <pre>Darshan-users mailing list<o:p></o:p></pre>
          <pre><a moz-do-not-send="true" href="mailto:Darshan-users@lists.mcs.anl.gov">Darshan-users@lists.mcs.anl.gov</a><o:p></o:p></pre>
          <pre><a moz-do-not-send="true" href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users</a><o:p></o:p></pre>
        </blockquote>
        <p class="MsoNormal"><span
            style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New
            Roman",serif;mso-fareast-language:EN-GB"><br>
            <br>
________________________________________________________________________<br>
            This e-mail has been scanned for all viruses by Star.<br>
________________________________________________________________________<o:p></o:p></span></p>
      </div>
      <hr width="100%">
      <p>The Numerical Algorithms Group Ltd is a company registered in
        England and Wales with company number 1249803. The registered
        office is:</p>
      <p>Wilkinson House, Jordan Hill Road, Oxford OX2 8DR, United
        Kingdom.</p>
      <p> </p>
      <p>This e-mail has been scanned for all viruses by Microsoft
        Office 365. </p>
      <hr width="100%">
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Darshan-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Darshan-users@lists.mcs.anl.gov">Darshan-users@lists.mcs.anl.gov</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/darshan-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <p><br>
    </p>
  </body>
</html>