<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Consolas;
        panose-1:2 11 6 9 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
pre
        {mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"HTML Preformatted Char";
        margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:10.0pt;
        font-family:"Courier New";}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
span.HTMLPreformattedChar
        {mso-style-name:"HTML Preformatted Char";
        mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"HTML Preformatted";
        font-family:"Courier New";}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
/* List Definitions */
@list l0
        {mso-list-id:621375645;
        mso-list-type:hybrid;
        mso-list-template-ids:-190967374 67698711 67698713 67698715 67698703 67698713 67698715 67698703 67698713 67698715;}
@list l0:level1
        {mso-level-number-format:alpha-lower;
        mso-level-text:"%1\)";
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level2
        {mso-level-number-format:alpha-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level3
        {mso-level-number-format:roman-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:right;
        text-indent:-9.0pt;}
@list l0:level4
        {mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level5
        {mso-level-number-format:alpha-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level6
        {mso-level-number-format:roman-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:right;
        text-indent:-9.0pt;}
@list l0:level7
        {mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level8
        {mso-level-number-format:alpha-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
@list l0:level9
        {mso-level-number-format:roman-lower;
        mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:right;
        text-indent:-9.0pt;}
ol
        {margin-bottom:0in;}
ul
        {margin-bottom:0in;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Hello,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">I have installed Darshan-3.0.1. I have couple of questions on darshan-summary-per-file.sh.<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">When I run darshan-summary-per-file.sh it gives the following error:<o:p></o:p></span></pre>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">#### BEGIN : output of darshan-summary-per-file.sh (using </span><span style="font-family:Consolas">mpi-io-test-x86_64-3.0.1.darshan from darshan-test)</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><o:p></o:p></span></pre>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">$ darshan-summary-per-file.sh mpi-io-test-x86_64-3.0.1.darshan output
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Status: Generating summary for file 1 of 1: mpi-io-test.tmp.dat<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">=======================================================<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Slowest unique file time: 0<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Slowest shared file time: 0.033856<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Total bytes read and written by app (may be incorrect): 134217728<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Total absolute I/O time: 0.033856<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">**NOTE: above shared and unique file times calculated using MPI-IO timers if MPI-IO interface used on a given file, POSIX timers otherwise.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">LaTeX generation (phase1) failed [256], aborting summary creation.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">error log:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">or enter new name. (Default extension: sty)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Enter file name:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">! Emergency stop.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><read *><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">l.9 \usepackage<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">               {color}^^M<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">!  ==> Fatal error occurred, no output PDF file produced!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Transcript written on summary.log.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">=======================================================<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">darshan-summary-per-file.sh done. Results can be found in output/*.pdf.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">#### END : output of darshan-summary-per-file.sh<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></pre>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">System specification:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Kernel Version: Linux 4.0.5-1.el7.elrepo.x86_64<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Operating System: CentOS Linux release 7.1.1503<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">CPU: Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2630 v3 @ 2.40GHz (Haswell-EP)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Architecture:x86_64<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">Compiler: GCC 5.1.0<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas">MPI: Intel MPI-5.1.2<o:p></o:p></span></p>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">I have the following questions:<o:p></o:p></span></pre>
<pre style="margin-left:.5in;text-indent:-.25in;mso-list:l0 level1 lfo1"><![if !supportLists]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><span style="mso-list:Ignore">a)<span style="font:7.0pt "Times New Roman"">  </span></span></span><![endif]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">The color.sty file is located at “/usr/share/texlive/texmf-dist/tex/latex/graphics/color.sty”. What could be the reason for error?<o:p></o:p></span></pre>
<pre style="margin-left:.5in;text-indent:-.25in;mso-list:l0 level1 lfo1"><![if !supportLists]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><span style="mso-list:Ignore">b)<span style="font:7.0pt "Times New Roman"">  </span></span></span><![endif]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">I have installed all the prerequisites mentioned in the Darshan-util installation page (zlib, libbz2 development headers and library (libbz2-dev or similar), Perl, pdflatex, gnuplot 4.2 or later, epstopdf), is there any other prerequisite required?<o:p></o:p></span></pre>
<pre style="margin-left:.5in;text-indent:-.25in;mso-list:l0 level1 lfo1"><![if !supportLists]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><span style="mso-list:Ignore">c)<span style="font:7.0pt "Times New Roman"">  </span></span></span><![endif]><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">At the end of the darshan-summary-per-file.sh run, it mentions “Transcript written on summary.log”. Where can I locate the log file?<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">I will greatly appreciate your response.<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">Thanks,<o:p></o:p></span></pre>
<pre><span style="font-size:11.0pt;font-family:Consolas">Preeti<o:p></o:p></span></pre>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Consolas"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
</body>
</html>